Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMG20AQ9NP66 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMG20AQ9NP66 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMG20AQ9NP66 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMG20AQ9NP66 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HMG20AQ9NP66 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HMG20AQ9NP66 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMG20AQ9NP66 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HMG20AQ9NP66 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HMG20AQ9NP66 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HMG20AQ9NP66 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
HMG20AQ9NP66 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMG20AQ9NP66 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMG20AQ9NP66 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HMG20AQ9NP66 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HMG20AQ9NP66 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HMG20AQ9NP66 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMG20AQ9NP66 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMG20AQ9NP66 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMG20AQ9NP66 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMG20AQ9NP66 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMG20AQ9NP66 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HMG20AQ9NP66 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HMG20AQ9NP66 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMG20AQ9NP66 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HMG20AQ9NP66 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMG20AQ9NP66 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMG20AQ9NP66 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMG20AQ9NP66 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMG20AQ9NP66 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMG20AQ9NP66 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMG20AQ9NP66 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMG20AQ9NP66 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMG20AQ9NP66 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMG20AQ9NP66 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMG20AQ9NP66 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMG20AQ9NP66 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMG20AQ9NP66 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMG20AQ9NP66 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMG20AQ9NP66 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMG20AQ9NP66 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMG20AQ9NP66 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMG20AQ9NP66 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HMG20AQ9NP66 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMG20AQ9NP66 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMG20AQ9NP66 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMG20AQ9NP66 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMG20AQ9NP66 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMG20AQ9NP66 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMG20AQ9NP66 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMG20AQ9NP66 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMG20AQ9NP66 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMG20AQ9NP66 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMG20AQ9NP66 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMG20AQ9NP66 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMG20AQ9NP66 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMG20AQ9NP66 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMG20AQ9NP66 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMG20AQ9NP66 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMG20AQ9NP66 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMG20AQ9NP66 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMG20AQ9NP66 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMG20AQ9NP66 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMG20AQ9NP66 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMG20AQ9NP66 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMG20AQ9NP66 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMG20AQ9NP66 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMG20AQ9NP66 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMG20AQ9NP66 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMG20AQ9NP66 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HMG20AQ9NP66 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HMG20AQ9NP66 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMG20AQ9NP66 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMG20AQ9NP66 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HMG20AQ9NP66 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMG20AQ9NP66 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HMG20AQ9NP66 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMG20AQ9NP66 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMG20AQ9NP66 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMG20AQ9NP66 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMG20AQ9NP66 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMG20AQ9NP66 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMG20AQ9NP66 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMG20AQ9NP66 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMG20AQ9NP66 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMG20AQ9NP66 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMG20AQ9NP66 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMG20AQ9NP66 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMG20AQ9NP66 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMG20AQ9NP66 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMG20AQ9NP66 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMG20AQ9NP66 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMG20AQ9NP66 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMG20AQ9NP66 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMG20AQ9NP66 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMG20AQ9NP66 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HMG20AQ9NP66 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMG20AQ9NP66 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HMG20AQ9NP66 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMG20AQ9NP66 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms