Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ABCB6Q9NP58 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ABCB6Q9NP58 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ABCB6Q9NP58 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ABCB6Q9NP58 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ABCB6Q9NP58 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
ABCB6Q9NP58 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ABCB6Q9NP58 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
ABCB6Q9NP58 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ABCB6Q9NP58 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ABCB6Q9NP58 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ABCB6Q9NP58 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ABCB6Q9NP58 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ABCB6Q9NP58 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCB6Q9NP58 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCB6Q9NP58 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCB6Q9NP58 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCB6Q9NP58 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCB6Q9NP58 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCB6Q9NP58 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCB6Q9NP58 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCB6Q9NP58 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCB6Q9NP58 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
ABCB6Q9NP58 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ABCB6Q9NP58 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ABCB6Q9NP58 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCB6Q9NP58 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCB6Q9NP58 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCB6Q9NP58 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCB6Q9NP58 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ABCB6Q9NP58 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ABCB6Q9NP58 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ABCB6Q9NP58 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
ABCB6Q9NP58 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ABCB6Q9NP58 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ABCB6Q9NP58 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ABCB6Q9NP58 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ABCB6Q9NP58 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ABCB6Q9NP58 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ABCB6Q9NP58 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ABCB6Q9NP58 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ABCB6Q9NP58 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ABCB6Q9NP58 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
ABCB6Q9NP58 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ABCB6Q9NP58 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ABCB6Q9NP58 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
ABCB6Q9NP58 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ABCB6Q9NP58 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ABCB6Q9NP58 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ABCB6Q9NP58 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ABCB6Q9NP58 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ABCB6Q9NP58 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ABCB6Q9NP58 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ABCB6Q9NP58 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ABCB6Q9NP58 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ABCB6Q9NP58 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ABCB6Q9NP58 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ABCB6Q9NP58 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ABCB6Q9NP58 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
ABCB6Q9NP58 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ABCB6Q9NP58 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ABCB6Q9NP58 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ABCB6Q9NP58 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ABCB6Q9NP58 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ABCB6Q9NP58 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.49
ABCB6Q9NP58 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
ABCB6Q9NP58 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ABCB6Q9NP58 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ABCB6Q9NP58 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ABCB6Q9NP58 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCB6Q9NP58 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCB6Q9NP58 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCB6Q9NP58 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCB6Q9NP58 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCB6Q9NP58 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCB6Q9NP58 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ABCB6Q9NP58 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCB6Q9NP58 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCB6Q9NP58 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ABCB6Q9NP58 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ABCB6Q9NP58 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ABCB6Q9NP58 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ABCB6Q9NP58 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ABCB6Q9NP58 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ABCB6Q9NP58 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ABCB6Q9NP58 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ABCB6Q9NP58 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ABCB6Q9NP58 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ABCB6Q9NP58 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ABCB6Q9NP58 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ABCB6Q9NP58 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ABCB6Q9NP58 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCB6Q9NP58 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCB6Q9NP58 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCB6Q9NP58 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCB6Q9NP58 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCB6Q9NP58 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCB6Q9NP58 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ABCB6Q9NP58 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ABCB6Q9NP58 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.2 ms