Protein–RNA interactions for Protein: Q9H841

NIPAL2, NIPA-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL2Q9H841 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NIPAL2Q9H841 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NIPAL2Q9H841 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NIPAL2Q9H841 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NIPAL2Q9H841 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NIPAL2Q9H841 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NIPAL2Q9H841 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NIPAL2Q9H841 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NIPAL2Q9H841 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NIPAL2Q9H841 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NIPAL2Q9H841 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NIPAL2Q9H841 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NIPAL2Q9H841 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NIPAL2Q9H841 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NIPAL2Q9H841 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NIPAL2Q9H841 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NIPAL2Q9H841 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NIPAL2Q9H841 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NIPAL2Q9H841 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NIPAL2Q9H841 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIPAL2Q9H841 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIPAL2Q9H841 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIPAL2Q9H841 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIPAL2Q9H841 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIPAL2Q9H841 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIPAL2Q9H841 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIPAL2Q9H841 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPAL2Q9H841 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPAL2Q9H841 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPAL2Q9H841 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIPAL2Q9H841 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPAL2Q9H841 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIPAL2Q9H841 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIPAL2Q9H841 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIPAL2Q9H841 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIPAL2Q9H841 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NIPAL2Q9H841 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NIPAL2Q9H841 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NIPAL2Q9H841 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NIPAL2Q9H841 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NIPAL2Q9H841 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NIPAL2Q9H841 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NIPAL2Q9H841 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NIPAL2Q9H841 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NIPAL2Q9H841 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NIPAL2Q9H841 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NIPAL2Q9H841 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NIPAL2Q9H841 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
NIPAL2Q9H841 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NIPAL2Q9H841 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NIPAL2Q9H841 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NIPAL2Q9H841 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NIPAL2Q9H841 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NIPAL2Q9H841 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NIPAL2Q9H841 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NIPAL2Q9H841 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NIPAL2Q9H841 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIPAL2Q9H841 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIPAL2Q9H841 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NIPAL2Q9H841 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NIPAL2Q9H841 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NIPAL2Q9H841 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NIPAL2Q9H841 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NIPAL2Q9H841 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIPAL2Q9H841 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIPAL2Q9H841 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIPAL2Q9H841 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NIPAL2Q9H841 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NIPAL2Q9H841 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIPAL2Q9H841 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIPAL2Q9H841 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIPAL2Q9H841 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIPAL2Q9H841 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIPAL2Q9H841 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIPAL2Q9H841 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPAL2Q9H841 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPAL2Q9H841 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPAL2Q9H841 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPAL2Q9H841 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPAL2Q9H841 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPAL2Q9H841 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPAL2Q9H841 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPAL2Q9H841 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPAL2Q9H841 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIPAL2Q9H841 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIPAL2Q9H841 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIPAL2Q9H841 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIPAL2Q9H841 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIPAL2Q9H841 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIPAL2Q9H841 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIPAL2Q9H841 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIPAL2Q9H841 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIPAL2Q9H841 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NIPAL2Q9H841 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NIPAL2Q9H841 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NIPAL2Q9H841 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NIPAL2Q9H841 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NIPAL2Q9H841 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NIPAL2Q9H841 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NIPAL2Q9H841 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms