Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
EBF3Q9H4W6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
EBF3Q9H4W6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
EBF3Q9H4W6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EBF3Q9H4W6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
EBF3Q9H4W6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
EBF3Q9H4W6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
EBF3Q9H4W6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
EBF3Q9H4W6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EBF3Q9H4W6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EBF3Q9H4W6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EBF3Q9H4W6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EBF3Q9H4W6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
EBF3Q9H4W6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EBF3Q9H4W6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
EBF3Q9H4W6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EBF3Q9H4W6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EBF3Q9H4W6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
EBF3Q9H4W6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
EBF3Q9H4W6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
EBF3Q9H4W6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
EBF3Q9H4W6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
EBF3Q9H4W6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
EBF3Q9H4W6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EBF3Q9H4W6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EBF3Q9H4W6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
EBF3Q9H4W6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EBF3Q9H4W6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
EBF3Q9H4W6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
EBF3Q9H4W6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
EBF3Q9H4W6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
EBF3Q9H4W6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
EBF3Q9H4W6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
EBF3Q9H4W6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
EBF3Q9H4W6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
EBF3Q9H4W6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
EBF3Q9H4W6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
EBF3Q9H4W6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EBF3Q9H4W6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
EBF3Q9H4W6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
EBF3Q9H4W6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EBF3Q9H4W6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EBF3Q9H4W6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EBF3Q9H4W6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EBF3Q9H4W6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EBF3Q9H4W6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EBF3Q9H4W6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EBF3Q9H4W6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EBF3Q9H4W6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EBF3Q9H4W6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EBF3Q9H4W6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EBF3Q9H4W6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EBF3Q9H4W6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EBF3Q9H4W6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EBF3Q9H4W6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EBF3Q9H4W6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EBF3Q9H4W6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
EBF3Q9H4W6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EBF3Q9H4W6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
EBF3Q9H4W6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
EBF3Q9H4W6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
EBF3Q9H4W6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
EBF3Q9H4W6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EBF3Q9H4W6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EBF3Q9H4W6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EBF3Q9H4W6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EBF3Q9H4W6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
EBF3Q9H4W6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EBF3Q9H4W6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EBF3Q9H4W6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
EBF3Q9H4W6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EBF3Q9H4W6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EBF3Q9H4W6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EBF3Q9H4W6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EBF3Q9H4W6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EBF3Q9H4W6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EBF3Q9H4W6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EBF3Q9H4W6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EBF3Q9H4W6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EBF3Q9H4W6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EBF3Q9H4W6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EBF3Q9H4W6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EBF3Q9H4W6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
EBF3Q9H4W6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EBF3Q9H4W6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
EBF3Q9H4W6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
EBF3Q9H4W6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EBF3Q9H4W6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EBF3Q9H4W6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EBF3Q9H4W6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EBF3Q9H4W6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EBF3Q9H4W6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EBF3Q9H4W6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EBF3Q9H4W6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EBF3Q9H4W6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EBF3Q9H4W6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EBF3Q9H4W6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EBF3Q9H4W6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EBF3Q9H4W6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EBF3Q9H4W6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms