Protein–RNA interactions for Protein: Q9H306

MMP27, Matrix metalloproteinase-27, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP27Q9H306 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP27Q9H306 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP27Q9H306 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP27Q9H306 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP27Q9H306 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP27Q9H306 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP27Q9H306 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP27Q9H306 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP27Q9H306 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MMP27Q9H306 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MMP27Q9H306 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMP27Q9H306 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP27Q9H306 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP27Q9H306 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP27Q9H306 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP27Q9H306 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMP27Q9H306 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MMP27Q9H306 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP27Q9H306 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP27Q9H306 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MMP27Q9H306 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MMP27Q9H306 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MMP27Q9H306 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP27Q9H306 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP27Q9H306 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MMP27Q9H306 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP27Q9H306 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP27Q9H306 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP27Q9H306 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MMP27Q9H306 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MMP27Q9H306 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP27Q9H306 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP27Q9H306 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP27Q9H306 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP27Q9H306 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP27Q9H306 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP27Q9H306 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP27Q9H306 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MMP27Q9H306 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP27Q9H306 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP27Q9H306 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP27Q9H306 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP27Q9H306 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP27Q9H306 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MMP27Q9H306 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP27Q9H306 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP27Q9H306 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP27Q9H306 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP27Q9H306 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP27Q9H306 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP27Q9H306 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP27Q9H306 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP27Q9H306 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP27Q9H306 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP27Q9H306 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP27Q9H306 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP27Q9H306 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP27Q9H306 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP27Q9H306 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP27Q9H306 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP27Q9H306 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP27Q9H306 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP27Q9H306 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP27Q9H306 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP27Q9H306 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP27Q9H306 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP27Q9H306 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP27Q9H306 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP27Q9H306 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP27Q9H306 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP27Q9H306 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP27Q9H306 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP27Q9H306 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP27Q9H306 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP27Q9H306 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MMP27Q9H306 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP27Q9H306 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP27Q9H306 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP27Q9H306 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP27Q9H306 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP27Q9H306 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP27Q9H306 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP27Q9H306 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP27Q9H306 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP27Q9H306 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MMP27Q9H306 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP27Q9H306 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP27Q9H306 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP27Q9H306 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP27Q9H306 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP27Q9H306 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP27Q9H306 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP27Q9H306 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP27Q9H306 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MMP27Q9H306 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP27Q9H306 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP27Q9H306 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP27Q9H306 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP27Q9H306 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP27Q9H306 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms