Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0A8

COMMD4, COMM domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD4Q9H0A8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COMMD4Q9H0A8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COMMD4Q9H0A8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COMMD4Q9H0A8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COMMD4Q9H0A8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COMMD4Q9H0A8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COMMD4Q9H0A8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COMMD4Q9H0A8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COMMD4Q9H0A8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COMMD4Q9H0A8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COMMD4Q9H0A8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COMMD4Q9H0A8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COMMD4Q9H0A8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COMMD4Q9H0A8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COMMD4Q9H0A8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COMMD4Q9H0A8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COMMD4Q9H0A8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COMMD4Q9H0A8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COMMD4Q9H0A8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COMMD4Q9H0A8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COMMD4Q9H0A8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COMMD4Q9H0A8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COMMD4Q9H0A8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COMMD4Q9H0A8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COMMD4Q9H0A8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COMMD4Q9H0A8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COMMD4Q9H0A8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COMMD4Q9H0A8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COMMD4Q9H0A8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COMMD4Q9H0A8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COMMD4Q9H0A8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COMMD4Q9H0A8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COMMD4Q9H0A8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COMMD4Q9H0A8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COMMD4Q9H0A8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COMMD4Q9H0A8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COMMD4Q9H0A8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COMMD4Q9H0A8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COMMD4Q9H0A8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COMMD4Q9H0A8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COMMD4Q9H0A8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COMMD4Q9H0A8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COMMD4Q9H0A8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COMMD4Q9H0A8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COMMD4Q9H0A8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COMMD4Q9H0A8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COMMD4Q9H0A8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COMMD4Q9H0A8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COMMD4Q9H0A8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COMMD4Q9H0A8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COMMD4Q9H0A8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COMMD4Q9H0A8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COMMD4Q9H0A8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COMMD4Q9H0A8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COMMD4Q9H0A8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COMMD4Q9H0A8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COMMD4Q9H0A8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COMMD4Q9H0A8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COMMD4Q9H0A8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COMMD4Q9H0A8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COMMD4Q9H0A8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COMMD4Q9H0A8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COMMD4Q9H0A8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COMMD4Q9H0A8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COMMD4Q9H0A8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COMMD4Q9H0A8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COMMD4Q9H0A8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COMMD4Q9H0A8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COMMD4Q9H0A8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COMMD4Q9H0A8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COMMD4Q9H0A8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COMMD4Q9H0A8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COMMD4Q9H0A8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COMMD4Q9H0A8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COMMD4Q9H0A8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COMMD4Q9H0A8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COMMD4Q9H0A8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COMMD4Q9H0A8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COMMD4Q9H0A8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COMMD4Q9H0A8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COMMD4Q9H0A8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COMMD4Q9H0A8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COMMD4Q9H0A8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COMMD4Q9H0A8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COMMD4Q9H0A8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COMMD4Q9H0A8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COMMD4Q9H0A8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COMMD4Q9H0A8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COMMD4Q9H0A8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COMMD4Q9H0A8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
COMMD4Q9H0A8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COMMD4Q9H0A8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COMMD4Q9H0A8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COMMD4Q9H0A8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COMMD4Q9H0A8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COMMD4Q9H0A8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COMMD4Q9H0A8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COMMD4Q9H0A8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COMMD4Q9H0A8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COMMD4Q9H0A8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
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