Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ6

CHRNA10, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA10Q9GZZ6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNA10Q9GZZ6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHRNA10Q9GZZ6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNA10Q9GZZ6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHRNA10Q9GZZ6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNA10Q9GZZ6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNA10Q9GZZ6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNA10Q9GZZ6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNA10Q9GZZ6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRNA10Q9GZZ6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRNA10Q9GZZ6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRNA10Q9GZZ6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRNA10Q9GZZ6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNA10Q9GZZ6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNA10Q9GZZ6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CHRNA10Q9GZZ6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNA10Q9GZZ6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNA10Q9GZZ6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHRNA10Q9GZZ6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA10Q9GZZ6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA10Q9GZZ6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNA10Q9GZZ6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRNA10Q9GZZ6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRNA10Q9GZZ6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNA10Q9GZZ6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNA10Q9GZZ6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNA10Q9GZZ6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNA10Q9GZZ6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNA10Q9GZZ6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNA10Q9GZZ6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNA10Q9GZZ6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNA10Q9GZZ6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNA10Q9GZZ6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRNA10Q9GZZ6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRNA10Q9GZZ6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHRNA10Q9GZZ6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHRNA10Q9GZZ6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNA10Q9GZZ6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHRNA10Q9GZZ6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA10Q9GZZ6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA10Q9GZZ6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA10Q9GZZ6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNA10Q9GZZ6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNA10Q9GZZ6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRNA10Q9GZZ6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRNA10Q9GZZ6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNA10Q9GZZ6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNA10Q9GZZ6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNA10Q9GZZ6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNA10Q9GZZ6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNA10Q9GZZ6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA10Q9GZZ6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA10Q9GZZ6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA10Q9GZZ6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNA10Q9GZZ6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNA10Q9GZZ6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHRNA10Q9GZZ6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CHRNA10Q9GZZ6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNA10Q9GZZ6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNA10Q9GZZ6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHRNA10Q9GZZ6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA10Q9GZZ6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHRNA10Q9GZZ6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHRNA10Q9GZZ6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNA10Q9GZZ6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNA10Q9GZZ6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNA10Q9GZZ6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNA10Q9GZZ6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNA10Q9GZZ6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNA10Q9GZZ6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHRNA10Q9GZZ6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHRNA10Q9GZZ6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRNA10Q9GZZ6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRNA10Q9GZZ6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRNA10Q9GZZ6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNA10Q9GZZ6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNA10Q9GZZ6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHRNA10Q9GZZ6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNA10Q9GZZ6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNA10Q9GZZ6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRNA10Q9GZZ6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNA10Q9GZZ6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNA10Q9GZZ6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNA10Q9GZZ6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA10Q9GZZ6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA10Q9GZZ6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA10Q9GZZ6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA10Q9GZZ6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA10Q9GZZ6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA10Q9GZZ6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA10Q9GZZ6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA10Q9GZZ6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNA10Q9GZZ6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNA10Q9GZZ6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNA10Q9GZZ6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNA10Q9GZZ6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNA10Q9GZZ6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNA10Q9GZZ6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNA10Q9GZZ6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHRNA10Q9GZZ6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms