Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZV3

SLC5A7, High affinity choline transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A7Q9GZV3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A7Q9GZV3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC5A7Q9GZV3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A7Q9GZV3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A7Q9GZV3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A7Q9GZV3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A7Q9GZV3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A7Q9GZV3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A7Q9GZV3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A7Q9GZV3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A7Q9GZV3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A7Q9GZV3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A7Q9GZV3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC5A7Q9GZV3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC5A7Q9GZV3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC5A7Q9GZV3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC5A7Q9GZV3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC5A7Q9GZV3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC5A7Q9GZV3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC5A7Q9GZV3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC5A7Q9GZV3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A7Q9GZV3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A7Q9GZV3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC5A7Q9GZV3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A7Q9GZV3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A7Q9GZV3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A7Q9GZV3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A7Q9GZV3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A7Q9GZV3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A7Q9GZV3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A7Q9GZV3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A7Q9GZV3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A7Q9GZV3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A7Q9GZV3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A7Q9GZV3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC5A7Q9GZV3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC5A7Q9GZV3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC5A7Q9GZV3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC5A7Q9GZV3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC5A7Q9GZV3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC5A7Q9GZV3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC5A7Q9GZV3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A7Q9GZV3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A7Q9GZV3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A7Q9GZV3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A7Q9GZV3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A7Q9GZV3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A7Q9GZV3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A7Q9GZV3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A7Q9GZV3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A7Q9GZV3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A7Q9GZV3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A7Q9GZV3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A7Q9GZV3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A7Q9GZV3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A7Q9GZV3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A7Q9GZV3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC5A7Q9GZV3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A7Q9GZV3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A7Q9GZV3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A7Q9GZV3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A7Q9GZV3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A7Q9GZV3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A7Q9GZV3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A7Q9GZV3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A7Q9GZV3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A7Q9GZV3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A7Q9GZV3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A7Q9GZV3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A7Q9GZV3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A7Q9GZV3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A7Q9GZV3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A7Q9GZV3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A7Q9GZV3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A7Q9GZV3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A7Q9GZV3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A7Q9GZV3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A7Q9GZV3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A7Q9GZV3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A7Q9GZV3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A7Q9GZV3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A7Q9GZV3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A7Q9GZV3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A7Q9GZV3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A7Q9GZV3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A7Q9GZV3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A7Q9GZV3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A7Q9GZV3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A7Q9GZV3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A7Q9GZV3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A7Q9GZV3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A7Q9GZV3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A7Q9GZV3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A7Q9GZV3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A7Q9GZV3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A7Q9GZV3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A7Q9GZV3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A7Q9GZV3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A7Q9GZV3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A7Q9GZV3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms