Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC90BQ9GZT6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC90BQ9GZT6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC90BQ9GZT6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC90BQ9GZT6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC90BQ9GZT6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC90BQ9GZT6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC90BQ9GZT6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC90BQ9GZT6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC90BQ9GZT6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC90BQ9GZT6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC90BQ9GZT6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC90BQ9GZT6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC90BQ9GZT6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC90BQ9GZT6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC90BQ9GZT6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC90BQ9GZT6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC90BQ9GZT6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC90BQ9GZT6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC90BQ9GZT6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC90BQ9GZT6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC90BQ9GZT6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC90BQ9GZT6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC90BQ9GZT6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC90BQ9GZT6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC90BQ9GZT6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC90BQ9GZT6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC90BQ9GZT6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC90BQ9GZT6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC90BQ9GZT6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC90BQ9GZT6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC90BQ9GZT6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC90BQ9GZT6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC90BQ9GZT6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC90BQ9GZT6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC90BQ9GZT6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC90BQ9GZT6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC90BQ9GZT6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC90BQ9GZT6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC90BQ9GZT6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC90BQ9GZT6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC90BQ9GZT6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC90BQ9GZT6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC90BQ9GZT6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC90BQ9GZT6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC90BQ9GZT6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC90BQ9GZT6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC90BQ9GZT6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC90BQ9GZT6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC90BQ9GZT6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC90BQ9GZT6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC90BQ9GZT6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC90BQ9GZT6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC90BQ9GZT6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC90BQ9GZT6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC90BQ9GZT6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC90BQ9GZT6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC90BQ9GZT6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC90BQ9GZT6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC90BQ9GZT6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC90BQ9GZT6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC90BQ9GZT6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC90BQ9GZT6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC90BQ9GZT6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC90BQ9GZT6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC90BQ9GZT6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC90BQ9GZT6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC90BQ9GZT6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC90BQ9GZT6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC90BQ9GZT6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC90BQ9GZT6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC90BQ9GZT6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC90BQ9GZT6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC90BQ9GZT6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC90BQ9GZT6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC90BQ9GZT6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC90BQ9GZT6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC90BQ9GZT6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC90BQ9GZT6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC90BQ9GZT6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC90BQ9GZT6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC90BQ9GZT6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC90BQ9GZT6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC90BQ9GZT6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC90BQ9GZT6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC90BQ9GZT6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC90BQ9GZT6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC90BQ9GZT6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC90BQ9GZT6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC90BQ9GZT6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC90BQ9GZT6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC90BQ9GZT6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC90BQ9GZT6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC90BQ9GZT6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC90BQ9GZT6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC90BQ9GZT6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC90BQ9GZT6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms