Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM55Q9BYV6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM55Q9BYV6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM55Q9BYV6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM55Q9BYV6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM55Q9BYV6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM55Q9BYV6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM55Q9BYV6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM55Q9BYV6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM55Q9BYV6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRIM55Q9BYV6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM55Q9BYV6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM55Q9BYV6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM55Q9BYV6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM55Q9BYV6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM55Q9BYV6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM55Q9BYV6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM55Q9BYV6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM55Q9BYV6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM55Q9BYV6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM55Q9BYV6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM55Q9BYV6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM55Q9BYV6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM55Q9BYV6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM55Q9BYV6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM55Q9BYV6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM55Q9BYV6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM55Q9BYV6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM55Q9BYV6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM55Q9BYV6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM55Q9BYV6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM55Q9BYV6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM55Q9BYV6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM55Q9BYV6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM55Q9BYV6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM55Q9BYV6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM55Q9BYV6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM55Q9BYV6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM55Q9BYV6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM55Q9BYV6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM55Q9BYV6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM55Q9BYV6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM55Q9BYV6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM55Q9BYV6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM55Q9BYV6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM55Q9BYV6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM55Q9BYV6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM55Q9BYV6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM55Q9BYV6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM55Q9BYV6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM55Q9BYV6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM55Q9BYV6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM55Q9BYV6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIM55Q9BYV6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIM55Q9BYV6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM55Q9BYV6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM55Q9BYV6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM55Q9BYV6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM55Q9BYV6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM55Q9BYV6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM55Q9BYV6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM55Q9BYV6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM55Q9BYV6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM55Q9BYV6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM55Q9BYV6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM55Q9BYV6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM55Q9BYV6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM55Q9BYV6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM55Q9BYV6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM55Q9BYV6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM55Q9BYV6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM55Q9BYV6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM55Q9BYV6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM55Q9BYV6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM55Q9BYV6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM55Q9BYV6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM55Q9BYV6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM55Q9BYV6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM55Q9BYV6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM55Q9BYV6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM55Q9BYV6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM55Q9BYV6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM55Q9BYV6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM55Q9BYV6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM55Q9BYV6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM55Q9BYV6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM55Q9BYV6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM55Q9BYV6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM55Q9BYV6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM55Q9BYV6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM55Q9BYV6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM55Q9BYV6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM55Q9BYV6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM55Q9BYV6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM55Q9BYV6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM55Q9BYV6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM55Q9BYV6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM55Q9BYV6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
TRIM55Q9BYV6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM55Q9BYV6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms