Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
CARD11Q9BXL7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
CARD11Q9BXL7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CARD11Q9BXL7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC41■■■■■ 4.15
CARD11Q9BXL7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CARD11Q9BXL7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CARD11Q9BXL7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
CARD11Q9BXL7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
CARD11Q9BXL7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
CARD11Q9BXL7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
CARD11Q9BXL7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
CARD11Q9BXL7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CARD11Q9BXL7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CARD11Q9BXL7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
CARD11Q9BXL7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
CARD11Q9BXL7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
CARD11Q9BXL7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
CARD11Q9BXL7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
CARD11Q9BXL7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
CARD11Q9BXL7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC40.79■■■■■ 4.12
CARD11Q9BXL7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
CARD11Q9BXL7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
CARD11Q9BXL7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
CARD11Q9BXL7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
CARD11Q9BXL7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
CARD11Q9BXL7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CARD11Q9BXL7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
CARD11Q9BXL7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
CARD11Q9BXL7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.11
CARD11Q9BXL7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
CARD11Q9BXL7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
CARD11Q9BXL7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CARD11Q9BXL7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
CARD11Q9BXL7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
CARD11Q9BXL7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
CARD11Q9BXL7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
CARD11Q9BXL7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
CARD11Q9BXL7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CARD11Q9BXL7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
CARD11Q9BXL7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
CARD11Q9BXL7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
CARD11Q9BXL7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
CARD11Q9BXL7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CARD11Q9BXL7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CARD11Q9BXL7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
CARD11Q9BXL7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CARD11Q9BXL7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
CARD11Q9BXL7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC40.3■■■■■ 4.04
CARD11Q9BXL7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
CARD11Q9BXL7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
CARD11Q9BXL7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CARD11Q9BXL7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CARD11Q9BXL7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CARD11Q9BXL7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CARD11Q9BXL7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
CARD11Q9BXL7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CARD11Q9BXL7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CARD11Q9BXL7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CARD11Q9BXL7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CARD11Q9BXL7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CARD11Q9BXL7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CARD11Q9BXL7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CARD11Q9BXL7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CARD11Q9BXL7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
CARD11Q9BXL7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4
CARD11Q9BXL7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
CARD11Q9BXL7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CARD11Q9BXL7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CARD11Q9BXL7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CARD11Q9BXL7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CARD11Q9BXL7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CARD11Q9BXL7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CARD11Q9BXL7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
CARD11Q9BXL7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
CARD11Q9BXL7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
CARD11Q9BXL7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
CARD11Q9BXL7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
CARD11Q9BXL7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CARD11Q9BXL7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CARD11Q9BXL7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
CARD11Q9BXL7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
CARD11Q9BXL7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
CARD11Q9BXL7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC39.74■■■■□ 3.95
CARD11Q9BXL7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.74■■■■□ 3.95
CARD11Q9BXL7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC39.72■■■■□ 3.95
CARD11Q9BXL7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
CARD11Q9BXL7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CARD11Q9BXL7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC39.7■■■■□ 3.95
CARD11Q9BXL7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
CARD11Q9BXL7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
CARD11Q9BXL7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
CARD11Q9BXL7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
CARD11Q9BXL7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
CARD11Q9BXL7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
CARD11Q9BXL7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC39.59■■■■□ 3.93
CARD11Q9BXL7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC39.59■■■■□ 3.93
CARD11Q9BXL7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CARD11Q9BXL7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.93
CARD11Q9BXL7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
CARD11Q9BXL7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms