Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWQ6

YIPF2, Protein YIPF2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF2Q9BWQ6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
YIPF2Q9BWQ6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
YIPF2Q9BWQ6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
YIPF2Q9BWQ6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
YIPF2Q9BWQ6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
YIPF2Q9BWQ6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
YIPF2Q9BWQ6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
YIPF2Q9BWQ6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
YIPF2Q9BWQ6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
YIPF2Q9BWQ6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
YIPF2Q9BWQ6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
YIPF2Q9BWQ6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
YIPF2Q9BWQ6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
YIPF2Q9BWQ6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
YIPF2Q9BWQ6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
YIPF2Q9BWQ6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
YIPF2Q9BWQ6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
YIPF2Q9BWQ6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
YIPF2Q9BWQ6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
YIPF2Q9BWQ6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
YIPF2Q9BWQ6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
YIPF2Q9BWQ6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
YIPF2Q9BWQ6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
YIPF2Q9BWQ6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
YIPF2Q9BWQ6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
YIPF2Q9BWQ6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
YIPF2Q9BWQ6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
YIPF2Q9BWQ6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
YIPF2Q9BWQ6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
YIPF2Q9BWQ6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
YIPF2Q9BWQ6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
YIPF2Q9BWQ6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
YIPF2Q9BWQ6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
YIPF2Q9BWQ6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
YIPF2Q9BWQ6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
YIPF2Q9BWQ6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
YIPF2Q9BWQ6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
YIPF2Q9BWQ6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
YIPF2Q9BWQ6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
YIPF2Q9BWQ6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
YIPF2Q9BWQ6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
YIPF2Q9BWQ6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
YIPF2Q9BWQ6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
YIPF2Q9BWQ6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
YIPF2Q9BWQ6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
YIPF2Q9BWQ6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
YIPF2Q9BWQ6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
YIPF2Q9BWQ6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
YIPF2Q9BWQ6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
YIPF2Q9BWQ6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
YIPF2Q9BWQ6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
YIPF2Q9BWQ6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
YIPF2Q9BWQ6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
YIPF2Q9BWQ6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
YIPF2Q9BWQ6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
YIPF2Q9BWQ6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
YIPF2Q9BWQ6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
YIPF2Q9BWQ6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
YIPF2Q9BWQ6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
YIPF2Q9BWQ6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
YIPF2Q9BWQ6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
YIPF2Q9BWQ6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
YIPF2Q9BWQ6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
YIPF2Q9BWQ6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
YIPF2Q9BWQ6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
YIPF2Q9BWQ6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
YIPF2Q9BWQ6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
YIPF2Q9BWQ6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
YIPF2Q9BWQ6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
YIPF2Q9BWQ6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
YIPF2Q9BWQ6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
YIPF2Q9BWQ6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
YIPF2Q9BWQ6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
YIPF2Q9BWQ6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
YIPF2Q9BWQ6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
YIPF2Q9BWQ6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
YIPF2Q9BWQ6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
YIPF2Q9BWQ6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
YIPF2Q9BWQ6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
YIPF2Q9BWQ6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
YIPF2Q9BWQ6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
YIPF2Q9BWQ6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
YIPF2Q9BWQ6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
YIPF2Q9BWQ6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
YIPF2Q9BWQ6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
YIPF2Q9BWQ6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
YIPF2Q9BWQ6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
YIPF2Q9BWQ6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
YIPF2Q9BWQ6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
YIPF2Q9BWQ6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
YIPF2Q9BWQ6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
YIPF2Q9BWQ6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
YIPF2Q9BWQ6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
YIPF2Q9BWQ6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
YIPF2Q9BWQ6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
YIPF2Q9BWQ6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
YIPF2Q9BWQ6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
YIPF2Q9BWQ6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
YIPF2Q9BWQ6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
YIPF2Q9BWQ6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms