Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT81

SOX7, Transcription factor SOX-7, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX7Q9BT81 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX7Q9BT81 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX7Q9BT81 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX7Q9BT81 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX7Q9BT81 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX7Q9BT81 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX7Q9BT81 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX7Q9BT81 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX7Q9BT81 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX7Q9BT81 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX7Q9BT81 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX7Q9BT81 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX7Q9BT81 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX7Q9BT81 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX7Q9BT81 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX7Q9BT81 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX7Q9BT81 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX7Q9BT81 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX7Q9BT81 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX7Q9BT81 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX7Q9BT81 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX7Q9BT81 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX7Q9BT81 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX7Q9BT81 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX7Q9BT81 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX7Q9BT81 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOX7Q9BT81 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOX7Q9BT81 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SOX7Q9BT81 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX7Q9BT81 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX7Q9BT81 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX7Q9BT81 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX7Q9BT81 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX7Q9BT81 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX7Q9BT81 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX7Q9BT81 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX7Q9BT81 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX7Q9BT81 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX7Q9BT81 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX7Q9BT81 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX7Q9BT81 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX7Q9BT81 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX7Q9BT81 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX7Q9BT81 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX7Q9BT81 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX7Q9BT81 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX7Q9BT81 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX7Q9BT81 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX7Q9BT81 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX7Q9BT81 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX7Q9BT81 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX7Q9BT81 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX7Q9BT81 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX7Q9BT81 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX7Q9BT81 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX7Q9BT81 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX7Q9BT81 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX7Q9BT81 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX7Q9BT81 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX7Q9BT81 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SOX7Q9BT81 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX7Q9BT81 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX7Q9BT81 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX7Q9BT81 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX7Q9BT81 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX7Q9BT81 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX7Q9BT81 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX7Q9BT81 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX7Q9BT81 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX7Q9BT81 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX7Q9BT81 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX7Q9BT81 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX7Q9BT81 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX7Q9BT81 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX7Q9BT81 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX7Q9BT81 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX7Q9BT81 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX7Q9BT81 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX7Q9BT81 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX7Q9BT81 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX7Q9BT81 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOX7Q9BT81 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX7Q9BT81 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX7Q9BT81 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX7Q9BT81 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX7Q9BT81 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX7Q9BT81 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX7Q9BT81 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX7Q9BT81 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX7Q9BT81 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX7Q9BT81 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX7Q9BT81 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX7Q9BT81 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX7Q9BT81 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX7Q9BT81 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX7Q9BT81 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX7Q9BT81 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX7Q9BT81 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOX7Q9BT81 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOX7Q9BT81 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms