Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT23

LIMD2, LIM domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD2Q9BT23 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIMD2Q9BT23 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIMD2Q9BT23 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LIMD2Q9BT23 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LIMD2Q9BT23 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LIMD2Q9BT23 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LIMD2Q9BT23 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LIMD2Q9BT23 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LIMD2Q9BT23 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LIMD2Q9BT23 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIMD2Q9BT23 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIMD2Q9BT23 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIMD2Q9BT23 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIMD2Q9BT23 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIMD2Q9BT23 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIMD2Q9BT23 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LIMD2Q9BT23 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LIMD2Q9BT23 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIMD2Q9BT23 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIMD2Q9BT23 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIMD2Q9BT23 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIMD2Q9BT23 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIMD2Q9BT23 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIMD2Q9BT23 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIMD2Q9BT23 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIMD2Q9BT23 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIMD2Q9BT23 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIMD2Q9BT23 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LIMD2Q9BT23 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIMD2Q9BT23 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIMD2Q9BT23 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIMD2Q9BT23 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIMD2Q9BT23 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIMD2Q9BT23 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIMD2Q9BT23 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIMD2Q9BT23 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIMD2Q9BT23 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIMD2Q9BT23 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIMD2Q9BT23 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIMD2Q9BT23 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIMD2Q9BT23 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIMD2Q9BT23 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIMD2Q9BT23 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIMD2Q9BT23 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIMD2Q9BT23 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD2Q9BT23 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD2Q9BT23 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD2Q9BT23 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIMD2Q9BT23 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIMD2Q9BT23 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIMD2Q9BT23 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIMD2Q9BT23 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIMD2Q9BT23 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIMD2Q9BT23 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIMD2Q9BT23 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIMD2Q9BT23 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIMD2Q9BT23 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIMD2Q9BT23 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIMD2Q9BT23 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMD2Q9BT23 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMD2Q9BT23 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMD2Q9BT23 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMD2Q9BT23 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMD2Q9BT23 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMD2Q9BT23 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMD2Q9BT23 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMD2Q9BT23 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMD2Q9BT23 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIMD2Q9BT23 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LIMD2Q9BT23 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIMD2Q9BT23 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIMD2Q9BT23 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIMD2Q9BT23 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIMD2Q9BT23 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIMD2Q9BT23 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIMD2Q9BT23 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIMD2Q9BT23 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMD2Q9BT23 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMD2Q9BT23 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIMD2Q9BT23 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIMD2Q9BT23 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LIMD2Q9BT23 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LIMD2Q9BT23 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LIMD2Q9BT23 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LIMD2Q9BT23 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LIMD2Q9BT23 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LIMD2Q9BT23 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIMD2Q9BT23 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIMD2Q9BT23 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIMD2Q9BT23 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIMD2Q9BT23 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIMD2Q9BT23 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIMD2Q9BT23 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIMD2Q9BT23 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIMD2Q9BT23 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMD2Q9BT23 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMD2Q9BT23 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMD2Q9BT23 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMD2Q9BT23 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMD2Q9BT23 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms