Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSG0

PRADC1, Protease-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1Q9BSG0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRADC1Q9BSG0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRADC1Q9BSG0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRADC1Q9BSG0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRADC1Q9BSG0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PRADC1Q9BSG0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRADC1Q9BSG0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRADC1Q9BSG0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRADC1Q9BSG0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRADC1Q9BSG0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRADC1Q9BSG0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRADC1Q9BSG0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRADC1Q9BSG0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRADC1Q9BSG0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRADC1Q9BSG0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRADC1Q9BSG0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRADC1Q9BSG0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRADC1Q9BSG0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRADC1Q9BSG0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRADC1Q9BSG0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRADC1Q9BSG0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRADC1Q9BSG0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRADC1Q9BSG0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PRADC1Q9BSG0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRADC1Q9BSG0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRADC1Q9BSG0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRADC1Q9BSG0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRADC1Q9BSG0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRADC1Q9BSG0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRADC1Q9BSG0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRADC1Q9BSG0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRADC1Q9BSG0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRADC1Q9BSG0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRADC1Q9BSG0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRADC1Q9BSG0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRADC1Q9BSG0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRADC1Q9BSG0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRADC1Q9BSG0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRADC1Q9BSG0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRADC1Q9BSG0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRADC1Q9BSG0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRADC1Q9BSG0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRADC1Q9BSG0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRADC1Q9BSG0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRADC1Q9BSG0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRADC1Q9BSG0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRADC1Q9BSG0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRADC1Q9BSG0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRADC1Q9BSG0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRADC1Q9BSG0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRADC1Q9BSG0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRADC1Q9BSG0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRADC1Q9BSG0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRADC1Q9BSG0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRADC1Q9BSG0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRADC1Q9BSG0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRADC1Q9BSG0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRADC1Q9BSG0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRADC1Q9BSG0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRADC1Q9BSG0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRADC1Q9BSG0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRADC1Q9BSG0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRADC1Q9BSG0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRADC1Q9BSG0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRADC1Q9BSG0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRADC1Q9BSG0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRADC1Q9BSG0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRADC1Q9BSG0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRADC1Q9BSG0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRADC1Q9BSG0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRADC1Q9BSG0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRADC1Q9BSG0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRADC1Q9BSG0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRADC1Q9BSG0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRADC1Q9BSG0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRADC1Q9BSG0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRADC1Q9BSG0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRADC1Q9BSG0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRADC1Q9BSG0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRADC1Q9BSG0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRADC1Q9BSG0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRADC1Q9BSG0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRADC1Q9BSG0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRADC1Q9BSG0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRADC1Q9BSG0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRADC1Q9BSG0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRADC1Q9BSG0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRADC1Q9BSG0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRADC1Q9BSG0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRADC1Q9BSG0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRADC1Q9BSG0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRADC1Q9BSG0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PRADC1Q9BSG0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRADC1Q9BSG0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRADC1Q9BSG0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRADC1Q9BSG0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRADC1Q9BSG0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRADC1Q9BSG0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRADC1Q9BSG0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRADC1Q9BSG0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms