Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR3

TMEM246, Transmembrane protein 246, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM246Q9BRR3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM246Q9BRR3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM246Q9BRR3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM246Q9BRR3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM246Q9BRR3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM246Q9BRR3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM246Q9BRR3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM246Q9BRR3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM246Q9BRR3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM246Q9BRR3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM246Q9BRR3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM246Q9BRR3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM246Q9BRR3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM246Q9BRR3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM246Q9BRR3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM246Q9BRR3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM246Q9BRR3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM246Q9BRR3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM246Q9BRR3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM246Q9BRR3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM246Q9BRR3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM246Q9BRR3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM246Q9BRR3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM246Q9BRR3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM246Q9BRR3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM246Q9BRR3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM246Q9BRR3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM246Q9BRR3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM246Q9BRR3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM246Q9BRR3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM246Q9BRR3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM246Q9BRR3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM246Q9BRR3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM246Q9BRR3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM246Q9BRR3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM246Q9BRR3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM246Q9BRR3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM246Q9BRR3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM246Q9BRR3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM246Q9BRR3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM246Q9BRR3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM246Q9BRR3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM246Q9BRR3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM246Q9BRR3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM246Q9BRR3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM246Q9BRR3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM246Q9BRR3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM246Q9BRR3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM246Q9BRR3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM246Q9BRR3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM246Q9BRR3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM246Q9BRR3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM246Q9BRR3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM246Q9BRR3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM246Q9BRR3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM246Q9BRR3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM246Q9BRR3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM246Q9BRR3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM246Q9BRR3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM246Q9BRR3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM246Q9BRR3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM246Q9BRR3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM246Q9BRR3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM246Q9BRR3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM246Q9BRR3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM246Q9BRR3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM246Q9BRR3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM246Q9BRR3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM246Q9BRR3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM246Q9BRR3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM246Q9BRR3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM246Q9BRR3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM246Q9BRR3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM246Q9BRR3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM246Q9BRR3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM246Q9BRR3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM246Q9BRR3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM246Q9BRR3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM246Q9BRR3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM246Q9BRR3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM246Q9BRR3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM246Q9BRR3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM246Q9BRR3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM246Q9BRR3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM246Q9BRR3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM246Q9BRR3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM246Q9BRR3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM246Q9BRR3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM246Q9BRR3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM246Q9BRR3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM246Q9BRR3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM246Q9BRR3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM246Q9BRR3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM246Q9BRR3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM246Q9BRR3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM246Q9BRR3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM246Q9BRR3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM246Q9BRR3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM246Q9BRR3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM246Q9BRR3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms