Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ0

PYGO2, Pygopus homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGO2Q9BRQ0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYGO2Q9BRQ0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYGO2Q9BRQ0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYGO2Q9BRQ0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PYGO2Q9BRQ0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PYGO2Q9BRQ0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PYGO2Q9BRQ0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PYGO2Q9BRQ0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PYGO2Q9BRQ0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PYGO2Q9BRQ0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PYGO2Q9BRQ0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PYGO2Q9BRQ0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PYGO2Q9BRQ0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PYGO2Q9BRQ0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYGO2Q9BRQ0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PYGO2Q9BRQ0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PYGO2Q9BRQ0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PYGO2Q9BRQ0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYGO2Q9BRQ0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYGO2Q9BRQ0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PYGO2Q9BRQ0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGO2Q9BRQ0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGO2Q9BRQ0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGO2Q9BRQ0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGO2Q9BRQ0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGO2Q9BRQ0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYGO2Q9BRQ0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYGO2Q9BRQ0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYGO2Q9BRQ0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYGO2Q9BRQ0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PYGO2Q9BRQ0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYGO2Q9BRQ0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYGO2Q9BRQ0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PYGO2Q9BRQ0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PYGO2Q9BRQ0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PYGO2Q9BRQ0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PYGO2Q9BRQ0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PYGO2Q9BRQ0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PYGO2Q9BRQ0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PYGO2Q9BRQ0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PYGO2Q9BRQ0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PYGO2Q9BRQ0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PYGO2Q9BRQ0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PYGO2Q9BRQ0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PYGO2Q9BRQ0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PYGO2Q9BRQ0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PYGO2Q9BRQ0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PYGO2Q9BRQ0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PYGO2Q9BRQ0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PYGO2Q9BRQ0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PYGO2Q9BRQ0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PYGO2Q9BRQ0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PYGO2Q9BRQ0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PYGO2Q9BRQ0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PYGO2Q9BRQ0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PYGO2Q9BRQ0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PYGO2Q9BRQ0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PYGO2Q9BRQ0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PYGO2Q9BRQ0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PYGO2Q9BRQ0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PYGO2Q9BRQ0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PYGO2Q9BRQ0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PYGO2Q9BRQ0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PYGO2Q9BRQ0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PYGO2Q9BRQ0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PYGO2Q9BRQ0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PYGO2Q9BRQ0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PYGO2Q9BRQ0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PYGO2Q9BRQ0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PYGO2Q9BRQ0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PYGO2Q9BRQ0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PYGO2Q9BRQ0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PYGO2Q9BRQ0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PYGO2Q9BRQ0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PYGO2Q9BRQ0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PYGO2Q9BRQ0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PYGO2Q9BRQ0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PYGO2Q9BRQ0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PYGO2Q9BRQ0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PYGO2Q9BRQ0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PYGO2Q9BRQ0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PYGO2Q9BRQ0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PYGO2Q9BRQ0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PYGO2Q9BRQ0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PYGO2Q9BRQ0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PYGO2Q9BRQ0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PYGO2Q9BRQ0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PYGO2Q9BRQ0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PYGO2Q9BRQ0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PYGO2Q9BRQ0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PYGO2Q9BRQ0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PYGO2Q9BRQ0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PYGO2Q9BRQ0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PYGO2Q9BRQ0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PYGO2Q9BRQ0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PYGO2Q9BRQ0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PYGO2Q9BRQ0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PYGO2Q9BRQ0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PYGO2Q9BRQ0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PYGO2Q9BRQ0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms