Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TREX2Q9BQ50 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TREX2Q9BQ50 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TREX2Q9BQ50 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TREX2Q9BQ50 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TREX2Q9BQ50 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TREX2Q9BQ50 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TREX2Q9BQ50 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TREX2Q9BQ50 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TREX2Q9BQ50 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TREX2Q9BQ50 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TREX2Q9BQ50 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TREX2Q9BQ50 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TREX2Q9BQ50 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TREX2Q9BQ50 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TREX2Q9BQ50 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TREX2Q9BQ50 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TREX2Q9BQ50 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TREX2Q9BQ50 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TREX2Q9BQ50 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TREX2Q9BQ50 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TREX2Q9BQ50 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TREX2Q9BQ50 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TREX2Q9BQ50 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TREX2Q9BQ50 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TREX2Q9BQ50 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TREX2Q9BQ50 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TREX2Q9BQ50 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TREX2Q9BQ50 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TREX2Q9BQ50 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TREX2Q9BQ50 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TREX2Q9BQ50 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TREX2Q9BQ50 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TREX2Q9BQ50 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TREX2Q9BQ50 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TREX2Q9BQ50 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TREX2Q9BQ50 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TREX2Q9BQ50 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TREX2Q9BQ50 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TREX2Q9BQ50 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TREX2Q9BQ50 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TREX2Q9BQ50 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TREX2Q9BQ50 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TREX2Q9BQ50 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TREX2Q9BQ50 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TREX2Q9BQ50 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TREX2Q9BQ50 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TREX2Q9BQ50 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TREX2Q9BQ50 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TREX2Q9BQ50 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TREX2Q9BQ50 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TREX2Q9BQ50 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TREX2Q9BQ50 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TREX2Q9BQ50 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TREX2Q9BQ50 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TREX2Q9BQ50 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TREX2Q9BQ50 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TREX2Q9BQ50 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TREX2Q9BQ50 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TREX2Q9BQ50 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TREX2Q9BQ50 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TREX2Q9BQ50 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TREX2Q9BQ50 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TREX2Q9BQ50 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TREX2Q9BQ50 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TREX2Q9BQ50 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TREX2Q9BQ50 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TREX2Q9BQ50 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TREX2Q9BQ50 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TREX2Q9BQ50 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TREX2Q9BQ50 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TREX2Q9BQ50 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TREX2Q9BQ50 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TREX2Q9BQ50 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TREX2Q9BQ50 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TREX2Q9BQ50 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TREX2Q9BQ50 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TREX2Q9BQ50 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TREX2Q9BQ50 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TREX2Q9BQ50 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TREX2Q9BQ50 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TREX2Q9BQ50 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TREX2Q9BQ50 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TREX2Q9BQ50 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TREX2Q9BQ50 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TREX2Q9BQ50 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TREX2Q9BQ50 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TREX2Q9BQ50 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TREX2Q9BQ50 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TREX2Q9BQ50 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TREX2Q9BQ50 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TREX2Q9BQ50 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TREX2Q9BQ50 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TREX2Q9BQ50 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TREX2Q9BQ50 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TREX2Q9BQ50 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TREX2Q9BQ50 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TREX2Q9BQ50 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TREX2Q9BQ50 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TREX2Q9BQ50 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms