Protein–RNA interactions for Protein: Q99895

CTRC, Chymotrypsin-C, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRCQ99895 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTRCQ99895 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTRCQ99895 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTRCQ99895 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTRCQ99895 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTRCQ99895 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTRCQ99895 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTRCQ99895 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTRCQ99895 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTRCQ99895 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTRCQ99895 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CTRCQ99895 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTRCQ99895 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTRCQ99895 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTRCQ99895 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTRCQ99895 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CTRCQ99895 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTRCQ99895 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTRCQ99895 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTRCQ99895 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTRCQ99895 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTRCQ99895 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTRCQ99895 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTRCQ99895 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTRCQ99895 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTRCQ99895 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTRCQ99895 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTRCQ99895 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CTRCQ99895 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTRCQ99895 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTRCQ99895 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CTRCQ99895 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTRCQ99895 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTRCQ99895 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTRCQ99895 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTRCQ99895 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTRCQ99895 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTRCQ99895 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTRCQ99895 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTRCQ99895 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTRCQ99895 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CTRCQ99895 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTRCQ99895 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTRCQ99895 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTRCQ99895 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTRCQ99895 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTRCQ99895 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTRCQ99895 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTRCQ99895 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTRCQ99895 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTRCQ99895 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTRCQ99895 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTRCQ99895 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTRCQ99895 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTRCQ99895 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTRCQ99895 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTRCQ99895 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTRCQ99895 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTRCQ99895 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTRCQ99895 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTRCQ99895 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTRCQ99895 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTRCQ99895 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTRCQ99895 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTRCQ99895 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTRCQ99895 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTRCQ99895 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CTRCQ99895 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTRCQ99895 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CTRCQ99895 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CTRCQ99895 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTRCQ99895 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTRCQ99895 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTRCQ99895 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CTRCQ99895 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTRCQ99895 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTRCQ99895 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTRCQ99895 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTRCQ99895 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTRCQ99895 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTRCQ99895 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTRCQ99895 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTRCQ99895 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTRCQ99895 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTRCQ99895 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTRCQ99895 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTRCQ99895 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTRCQ99895 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CTRCQ99895 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTRCQ99895 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTRCQ99895 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTRCQ99895 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CTRCQ99895 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTRCQ99895 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTRCQ99895 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTRCQ99895 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTRCQ99895 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTRCQ99895 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTRCQ99895 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTRCQ99895 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms