Protein–RNA interactions for Protein: Q99741

CDC6, Cell division control protein 6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC6Q99741 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDC6Q99741 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDC6Q99741 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDC6Q99741 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDC6Q99741 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDC6Q99741 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDC6Q99741 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDC6Q99741 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDC6Q99741 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDC6Q99741 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDC6Q99741 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDC6Q99741 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDC6Q99741 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDC6Q99741 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CDC6Q99741 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDC6Q99741 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDC6Q99741 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDC6Q99741 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDC6Q99741 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDC6Q99741 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDC6Q99741 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDC6Q99741 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDC6Q99741 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDC6Q99741 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CDC6Q99741 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDC6Q99741 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDC6Q99741 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDC6Q99741 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDC6Q99741 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDC6Q99741 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDC6Q99741 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDC6Q99741 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDC6Q99741 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC6Q99741 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC6Q99741 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDC6Q99741 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CDC6Q99741 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDC6Q99741 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDC6Q99741 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC6Q99741 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC6Q99741 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC6Q99741 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDC6Q99741 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC6Q99741 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC6Q99741 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC6Q99741 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC6Q99741 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC6Q99741 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC6Q99741 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC6Q99741 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC6Q99741 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CDC6Q99741 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDC6Q99741 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC6Q99741 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC6Q99741 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDC6Q99741 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDC6Q99741 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDC6Q99741 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDC6Q99741 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDC6Q99741 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDC6Q99741 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDC6Q99741 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDC6Q99741 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDC6Q99741 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDC6Q99741 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC6Q99741 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC6Q99741 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC6Q99741 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC6Q99741 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC6Q99741 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC6Q99741 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC6Q99741 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC6Q99741 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC6Q99741 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC6Q99741 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC6Q99741 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC6Q99741 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC6Q99741 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC6Q99741 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC6Q99741 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC6Q99741 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC6Q99741 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC6Q99741 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC6Q99741 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC6Q99741 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC6Q99741 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC6Q99741 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDC6Q99741 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDC6Q99741 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CDC6Q99741 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDC6Q99741 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDC6Q99741 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDC6Q99741 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDC6Q99741 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CDC6Q99741 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDC6Q99741 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC6Q99741 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC6Q99741 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDC6Q99741 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDC6Q99741 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms