Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHF12Q96QT6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PHF12Q96QT6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PHF12Q96QT6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PHF12Q96QT6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHF12Q96QT6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHF12Q96QT6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PHF12Q96QT6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHF12Q96QT6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHF12Q96QT6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHF12Q96QT6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHF12Q96QT6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHF12Q96QT6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHF12Q96QT6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHF12Q96QT6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHF12Q96QT6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHF12Q96QT6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHF12Q96QT6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHF12Q96QT6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHF12Q96QT6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHF12Q96QT6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHF12Q96QT6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF12Q96QT6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHF12Q96QT6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHF12Q96QT6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHF12Q96QT6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHF12Q96QT6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHF12Q96QT6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF12Q96QT6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHF12Q96QT6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHF12Q96QT6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHF12Q96QT6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF12Q96QT6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF12Q96QT6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHF12Q96QT6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHF12Q96QT6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHF12Q96QT6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF12Q96QT6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHF12Q96QT6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHF12Q96QT6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PHF12Q96QT6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PHF12Q96QT6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHF12Q96QT6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF12Q96QT6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF12Q96QT6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHF12Q96QT6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHF12Q96QT6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHF12Q96QT6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHF12Q96QT6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PHF12Q96QT6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHF12Q96QT6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHF12Q96QT6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHF12Q96QT6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF12Q96QT6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF12Q96QT6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF12Q96QT6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF12Q96QT6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF12Q96QT6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF12Q96QT6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF12Q96QT6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF12Q96QT6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHF12Q96QT6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHF12Q96QT6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHF12Q96QT6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHF12Q96QT6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHF12Q96QT6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHF12Q96QT6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHF12Q96QT6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHF12Q96QT6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHF12Q96QT6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHF12Q96QT6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHF12Q96QT6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHF12Q96QT6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHF12Q96QT6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHF12Q96QT6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHF12Q96QT6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHF12Q96QT6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHF12Q96QT6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHF12Q96QT6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHF12Q96QT6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHF12Q96QT6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHF12Q96QT6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHF12Q96QT6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHF12Q96QT6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF12Q96QT6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF12Q96QT6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PHF12Q96QT6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHF12Q96QT6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHF12Q96QT6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHF12Q96QT6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHF12Q96QT6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHF12Q96QT6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHF12Q96QT6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHF12Q96QT6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHF12Q96QT6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHF12Q96QT6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHF12Q96QT6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHF12Q96QT6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF12Q96QT6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PHF12Q96QT6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms