Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB3IPQ96QF0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB3IPQ96QF0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAB3IPQ96QF0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAB3IPQ96QF0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB3IPQ96QF0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB3IPQ96QF0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAB3IPQ96QF0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAB3IPQ96QF0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB3IPQ96QF0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAB3IPQ96QF0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB3IPQ96QF0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB3IPQ96QF0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAB3IPQ96QF0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB3IPQ96QF0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB3IPQ96QF0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB3IPQ96QF0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAB3IPQ96QF0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB3IPQ96QF0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB3IPQ96QF0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAB3IPQ96QF0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAB3IPQ96QF0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB3IPQ96QF0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB3IPQ96QF0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB3IPQ96QF0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB3IPQ96QF0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB3IPQ96QF0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB3IPQ96QF0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB3IPQ96QF0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB3IPQ96QF0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAB3IPQ96QF0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB3IPQ96QF0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB3IPQ96QF0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB3IPQ96QF0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB3IPQ96QF0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB3IPQ96QF0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB3IPQ96QF0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAB3IPQ96QF0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB3IPQ96QF0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB3IPQ96QF0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB3IPQ96QF0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB3IPQ96QF0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB3IPQ96QF0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB3IPQ96QF0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB3IPQ96QF0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB3IPQ96QF0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB3IPQ96QF0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB3IPQ96QF0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB3IPQ96QF0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB3IPQ96QF0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB3IPQ96QF0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RAB3IPQ96QF0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB3IPQ96QF0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB3IPQ96QF0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB3IPQ96QF0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB3IPQ96QF0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
RAB3IPQ96QF0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB3IPQ96QF0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB3IPQ96QF0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB3IPQ96QF0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB3IPQ96QF0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB3IPQ96QF0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB3IPQ96QF0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB3IPQ96QF0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB3IPQ96QF0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3IPQ96QF0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3IPQ96QF0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3IPQ96QF0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB3IPQ96QF0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB3IPQ96QF0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB3IPQ96QF0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB3IPQ96QF0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAB3IPQ96QF0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAB3IPQ96QF0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAB3IPQ96QF0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAB3IPQ96QF0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAB3IPQ96QF0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAB3IPQ96QF0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAB3IPQ96QF0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB3IPQ96QF0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB3IPQ96QF0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAB3IPQ96QF0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB3IPQ96QF0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB3IPQ96QF0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB3IPQ96QF0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3IPQ96QF0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3IPQ96QF0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3IPQ96QF0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3IPQ96QF0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3IPQ96QF0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3IPQ96QF0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3IPQ96QF0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB3IPQ96QF0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB3IPQ96QF0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB3IPQ96QF0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB3IPQ96QF0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB3IPQ96QF0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB3IPQ96QF0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB3IPQ96QF0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB3IPQ96QF0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms