Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZIM3Q96PE6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZIM3Q96PE6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZIM3Q96PE6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZIM3Q96PE6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZIM3Q96PE6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZIM3Q96PE6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZIM3Q96PE6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZIM3Q96PE6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ZIM3Q96PE6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZIM3Q96PE6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZIM3Q96PE6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ZIM3Q96PE6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZIM3Q96PE6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZIM3Q96PE6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZIM3Q96PE6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZIM3Q96PE6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZIM3Q96PE6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZIM3Q96PE6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZIM3Q96PE6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZIM3Q96PE6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZIM3Q96PE6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZIM3Q96PE6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ZIM3Q96PE6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZIM3Q96PE6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZIM3Q96PE6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZIM3Q96PE6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZIM3Q96PE6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZIM3Q96PE6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZIM3Q96PE6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZIM3Q96PE6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZIM3Q96PE6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZIM3Q96PE6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZIM3Q96PE6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZIM3Q96PE6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZIM3Q96PE6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZIM3Q96PE6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZIM3Q96PE6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZIM3Q96PE6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZIM3Q96PE6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZIM3Q96PE6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZIM3Q96PE6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZIM3Q96PE6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZIM3Q96PE6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZIM3Q96PE6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZIM3Q96PE6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZIM3Q96PE6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZIM3Q96PE6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZIM3Q96PE6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZIM3Q96PE6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZIM3Q96PE6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZIM3Q96PE6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZIM3Q96PE6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZIM3Q96PE6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZIM3Q96PE6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZIM3Q96PE6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZIM3Q96PE6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZIM3Q96PE6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZIM3Q96PE6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZIM3Q96PE6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZIM3Q96PE6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZIM3Q96PE6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZIM3Q96PE6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZIM3Q96PE6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZIM3Q96PE6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZIM3Q96PE6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZIM3Q96PE6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZIM3Q96PE6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZIM3Q96PE6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZIM3Q96PE6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZIM3Q96PE6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ZIM3Q96PE6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZIM3Q96PE6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZIM3Q96PE6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZIM3Q96PE6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZIM3Q96PE6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZIM3Q96PE6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZIM3Q96PE6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZIM3Q96PE6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZIM3Q96PE6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZIM3Q96PE6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZIM3Q96PE6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZIM3Q96PE6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZIM3Q96PE6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZIM3Q96PE6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZIM3Q96PE6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZIM3Q96PE6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZIM3Q96PE6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZIM3Q96PE6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZIM3Q96PE6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZIM3Q96PE6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZIM3Q96PE6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZIM3Q96PE6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ZIM3Q96PE6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZIM3Q96PE6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZIM3Q96PE6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZIM3Q96PE6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZIM3Q96PE6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZIM3Q96PE6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZIM3Q96PE6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms