Protein–RNA interactions for Protein: Q96L42

KCNH8, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH8Q96L42 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC46.53■■■■■ 5.04
KCNH8Q96L42 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC46.47■■■■■ 5.03
KCNH8Q96L42 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC46.46■■■■■ 5.03
KCNH8Q96L42 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
KCNH8Q96L42 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC46.44■■■■■ 5.02
KCNH8Q96L42 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC46.42■■■■■ 5.02
KCNH8Q96L42 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC46.41■■■■■ 5.02
KCNH8Q96L42 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
KCNH8Q96L42 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.02
KCNH8Q96L42 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC46.31■■■■■ 5
KCNH8Q96L42 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC46.31■■■■■ 5
KCNH8Q96L42 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.23■■■■■ 4.99
KCNH8Q96L42 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.15■■■■■ 4.98
KCNH8Q96L42 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.97
KCNH8Q96L42 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
KCNH8Q96L42 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.08■■■■■ 4.97
KCNH8Q96L42 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.07■■■■■ 4.96
KCNH8Q96L42 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC46.05■■■■■ 4.96
KCNH8Q96L42 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC45.95■■■■■ 4.95
KCNH8Q96L42 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
KCNH8Q96L42 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
KCNH8Q96L42 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC45.9■■■■■ 4.94
KCNH8Q96L42 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC45.9■■■■■ 4.94
KCNH8Q96L42 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC45.85■■■■■ 4.93
KCNH8Q96L42 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
KCNH8Q96L42 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC45.82■■■■■ 4.93
KCNH8Q96L42 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.92
KCNH8Q96L42 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC45.8■■■■■ 4.92
KCNH8Q96L42 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC45.78■■■■■ 4.92
KCNH8Q96L42 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
KCNH8Q96L42 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC45.73■■■■■ 4.91
KCNH8Q96L42 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC45.73■■■■■ 4.91
KCNH8Q96L42 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
KCNH8Q96L42 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC45.62■■■■■ 4.89
KCNH8Q96L42 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
KCNH8Q96L42 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
KCNH8Q96L42 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC45.58■■■■■ 4.89
KCNH8Q96L42 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.88
KCNH8Q96L42 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC45.55■■■■■ 4.88
KCNH8Q96L42 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC45.55■■■■■ 4.88
KCNH8Q96L42 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
KCNH8Q96L42 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.54■■■■■ 4.88
KCNH8Q96L42 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC45.53■■■■■ 4.88
KCNH8Q96L42 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC45.53■■■■■ 4.88
KCNH8Q96L42 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC45.52■■■■■ 4.88
KCNH8Q96L42 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC45.49■■■■■ 4.87
KCNH8Q96L42 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
KCNH8Q96L42 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
KCNH8Q96L42 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC45.42■■■■■ 4.86
KCNH8Q96L42 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC45.39■■■■■ 4.86
KCNH8Q96L42 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
KCNH8Q96L42 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
KCNH8Q96L42 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC45.33■■■■■ 4.85
KCNH8Q96L42 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.3■■■■■ 4.84
KCNH8Q96L42 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
KCNH8Q96L42 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.25■■■■■ 4.83
KCNH8Q96L42 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC45.22■■■■■ 4.83
KCNH8Q96L42 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC45.18■■■■■ 4.82
KCNH8Q96L42 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.16■■■■■ 4.82
KCNH8Q96L42 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC45.13■■■■■ 4.82
KCNH8Q96L42 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.81
KCNH8Q96L42 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
KCNH8Q96L42 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
KCNH8Q96L42 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC45.03■■■■■ 4.8
KCNH8Q96L42 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
KCNH8Q96L42 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC45.01■■■■■ 4.8
KCNH8Q96L42 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC45.01■■■■■ 4.8
KCNH8Q96L42 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45■■■■■ 4.79
KCNH8Q96L42 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC44.96■■■■■ 4.79
KCNH8Q96L42 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
KCNH8Q96L42 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
KCNH8Q96L42 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
KCNH8Q96L42 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
KCNH8Q96L42 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
KCNH8Q96L42 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
KCNH8Q96L42 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC44.82■■■■■ 4.77
KCNH8Q96L42 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.81■■■■■ 4.76
KCNH8Q96L42 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC44.81■■■■■ 4.76
KCNH8Q96L42 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.76■■■■■ 4.76
KCNH8Q96L42 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC44.73■■■■■ 4.75
KCNH8Q96L42 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
KCNH8Q96L42 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
KCNH8Q96L42 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.7■■■■■ 4.75
KCNH8Q96L42 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.75
KCNH8Q96L42 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC44.69■■■■■ 4.74
KCNH8Q96L42 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
KCNH8Q96L42 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
KCNH8Q96L42 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
KCNH8Q96L42 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC44.66■■■■■ 4.74
KCNH8Q96L42 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC44.66■■■■■ 4.74
KCNH8Q96L42 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
KCNH8Q96L42 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC44.62■■■■■ 4.73
KCNH8Q96L42 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
KCNH8Q96L42 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
KCNH8Q96L42 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC44.55■■■■■ 4.72
KCNH8Q96L42 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC44.54■■■■■ 4.72
KCNH8Q96L42 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.54■■■■■ 4.72
KCNH8Q96L42 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
KCNH8Q96L42 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC44.52■■■■■ 4.72
KCNH8Q96L42 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC44.52■■■■■ 4.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms