Protein–RNA interactions for Protein: Q96K19

RNF170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF170Q96K19 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF170Q96K19 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF170Q96K19 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF170Q96K19 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF170Q96K19 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF170Q96K19 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF170Q96K19 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF170Q96K19 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF170Q96K19 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF170Q96K19 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF170Q96K19 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF170Q96K19 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF170Q96K19 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF170Q96K19 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF170Q96K19 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF170Q96K19 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF170Q96K19 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF170Q96K19 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF170Q96K19 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF170Q96K19 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF170Q96K19 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF170Q96K19 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF170Q96K19 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF170Q96K19 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF170Q96K19 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF170Q96K19 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF170Q96K19 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF170Q96K19 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF170Q96K19 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF170Q96K19 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF170Q96K19 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF170Q96K19 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF170Q96K19 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF170Q96K19 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF170Q96K19 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF170Q96K19 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF170Q96K19 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF170Q96K19 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF170Q96K19 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF170Q96K19 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF170Q96K19 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF170Q96K19 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF170Q96K19 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF170Q96K19 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF170Q96K19 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF170Q96K19 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF170Q96K19 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF170Q96K19 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF170Q96K19 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF170Q96K19 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF170Q96K19 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF170Q96K19 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF170Q96K19 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF170Q96K19 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF170Q96K19 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF170Q96K19 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF170Q96K19 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF170Q96K19 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF170Q96K19 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF170Q96K19 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF170Q96K19 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF170Q96K19 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF170Q96K19 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF170Q96K19 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF170Q96K19 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF170Q96K19 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF170Q96K19 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF170Q96K19 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF170Q96K19 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF170Q96K19 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF170Q96K19 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF170Q96K19 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF170Q96K19 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF170Q96K19 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF170Q96K19 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF170Q96K19 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF170Q96K19 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF170Q96K19 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF170Q96K19 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF170Q96K19 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF170Q96K19 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF170Q96K19 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF170Q96K19 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF170Q96K19 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF170Q96K19 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF170Q96K19 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF170Q96K19 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF170Q96K19 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF170Q96K19 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF170Q96K19 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF170Q96K19 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF170Q96K19 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF170Q96K19 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF170Q96K19 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF170Q96K19 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF170Q96K19 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF170Q96K19 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF170Q96K19 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF170Q96K19 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF170Q96K19 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms