Protein–RNA interactions for Protein: Q96HH9

GRAMD2B, GRAM domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD2BQ96HH9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD2BQ96HH9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD2BQ96HH9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRAMD2BQ96HH9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRAMD2BQ96HH9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRAMD2BQ96HH9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRAMD2BQ96HH9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRAMD2BQ96HH9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRAMD2BQ96HH9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRAMD2BQ96HH9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRAMD2BQ96HH9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRAMD2BQ96HH9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD2BQ96HH9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD2BQ96HH9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD2BQ96HH9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD2BQ96HH9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD2BQ96HH9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD2BQ96HH9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD2BQ96HH9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRAMD2BQ96HH9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD2BQ96HH9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD2BQ96HH9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD2BQ96HH9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD2BQ96HH9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD2BQ96HH9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRAMD2BQ96HH9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD2BQ96HH9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD2BQ96HH9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD2BQ96HH9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD2BQ96HH9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD2BQ96HH9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD2BQ96HH9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD2BQ96HH9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD2BQ96HH9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD2BQ96HH9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRAMD2BQ96HH9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRAMD2BQ96HH9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRAMD2BQ96HH9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRAMD2BQ96HH9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD2BQ96HH9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD2BQ96HH9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD2BQ96HH9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD2BQ96HH9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRAMD2BQ96HH9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRAMD2BQ96HH9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRAMD2BQ96HH9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRAMD2BQ96HH9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRAMD2BQ96HH9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRAMD2BQ96HH9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD2BQ96HH9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRAMD2BQ96HH9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRAMD2BQ96HH9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRAMD2BQ96HH9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GRAMD2BQ96HH9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRAMD2BQ96HH9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRAMD2BQ96HH9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRAMD2BQ96HH9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRAMD2BQ96HH9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRAMD2BQ96HH9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRAMD2BQ96HH9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRAMD2BQ96HH9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRAMD2BQ96HH9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRAMD2BQ96HH9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRAMD2BQ96HH9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRAMD2BQ96HH9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRAMD2BQ96HH9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRAMD2BQ96HH9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRAMD2BQ96HH9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRAMD2BQ96HH9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRAMD2BQ96HH9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRAMD2BQ96HH9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRAMD2BQ96HH9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRAMD2BQ96HH9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRAMD2BQ96HH9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRAMD2BQ96HH9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GRAMD2BQ96HH9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRAMD2BQ96HH9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRAMD2BQ96HH9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRAMD2BQ96HH9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRAMD2BQ96HH9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRAMD2BQ96HH9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRAMD2BQ96HH9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRAMD2BQ96HH9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRAMD2BQ96HH9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRAMD2BQ96HH9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD2BQ96HH9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD2BQ96HH9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRAMD2BQ96HH9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRAMD2BQ96HH9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRAMD2BQ96HH9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRAMD2BQ96HH9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRAMD2BQ96HH9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRAMD2BQ96HH9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRAMD2BQ96HH9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRAMD2BQ96HH9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRAMD2BQ96HH9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRAMD2BQ96HH9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRAMD2BQ96HH9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRAMD2BQ96HH9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRAMD2BQ96HH9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms