Protein–RNA interactions for Protein: Q93062

RBPMS, RNA-binding protein with multiple splicing, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBPMSQ93062 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBPMSQ93062 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBPMSQ93062 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBPMSQ93062 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBPMSQ93062 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBPMSQ93062 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBPMSQ93062 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBPMSQ93062 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBPMSQ93062 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBPMSQ93062 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBPMSQ93062 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RBPMSQ93062 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBPMSQ93062 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBPMSQ93062 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBPMSQ93062 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBPMSQ93062 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBPMSQ93062 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBPMSQ93062 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBPMSQ93062 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBPMSQ93062 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBPMSQ93062 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBPMSQ93062 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBPMSQ93062 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBPMSQ93062 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBPMSQ93062 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBPMSQ93062 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBPMSQ93062 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBPMSQ93062 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBPMSQ93062 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBPMSQ93062 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBPMSQ93062 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBPMSQ93062 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBPMSQ93062 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBPMSQ93062 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBPMSQ93062 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBPMSQ93062 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBPMSQ93062 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBPMSQ93062 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBPMSQ93062 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBPMSQ93062 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBPMSQ93062 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBPMSQ93062 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBPMSQ93062 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBPMSQ93062 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBPMSQ93062 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBPMSQ93062 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBPMSQ93062 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBPMSQ93062 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBPMSQ93062 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
RBPMSQ93062 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBPMSQ93062 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RBPMSQ93062 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBPMSQ93062 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBPMSQ93062 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBPMSQ93062 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBPMSQ93062 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBPMSQ93062 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBPMSQ93062 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBPMSQ93062 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBPMSQ93062 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBPMSQ93062 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBPMSQ93062 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBPMSQ93062 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBPMSQ93062 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBPMSQ93062 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBPMSQ93062 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBPMSQ93062 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBPMSQ93062 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBPMSQ93062 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBPMSQ93062 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBPMSQ93062 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBPMSQ93062 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBPMSQ93062 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBPMSQ93062 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBPMSQ93062 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBPMSQ93062 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBPMSQ93062 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBPMSQ93062 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBPMSQ93062 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBPMSQ93062 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBPMSQ93062 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBPMSQ93062 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBPMSQ93062 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBPMSQ93062 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBPMSQ93062 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBPMSQ93062 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBPMSQ93062 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBPMSQ93062 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBPMSQ93062 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBPMSQ93062 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBPMSQ93062 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBPMSQ93062 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBPMSQ93062 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBPMSQ93062 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBPMSQ93062 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBPMSQ93062 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBPMSQ93062 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBPMSQ93062 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBPMSQ93062 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBPMSQ93062 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms