Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
ATRIPQ8WXE1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ATRIPQ8WXE1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ATRIPQ8WXE1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ATRIPQ8WXE1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ATRIPQ8WXE1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATRIPQ8WXE1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ATRIPQ8WXE1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ATRIPQ8WXE1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATRIPQ8WXE1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ATRIPQ8WXE1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ATRIPQ8WXE1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ATRIPQ8WXE1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ATRIPQ8WXE1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ATRIPQ8WXE1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
ATRIPQ8WXE1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ATRIPQ8WXE1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ATRIPQ8WXE1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ATRIPQ8WXE1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ATRIPQ8WXE1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
ATRIPQ8WXE1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ATRIPQ8WXE1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ATRIPQ8WXE1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ATRIPQ8WXE1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ATRIPQ8WXE1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATRIPQ8WXE1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
ATRIPQ8WXE1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATRIPQ8WXE1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ATRIPQ8WXE1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATRIPQ8WXE1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATRIPQ8WXE1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
ATRIPQ8WXE1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ATRIPQ8WXE1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ATRIPQ8WXE1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ATRIPQ8WXE1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATRIPQ8WXE1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATRIPQ8WXE1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATRIPQ8WXE1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATRIPQ8WXE1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ATRIPQ8WXE1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATRIPQ8WXE1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATRIPQ8WXE1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATRIPQ8WXE1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATRIPQ8WXE1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATRIPQ8WXE1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATRIPQ8WXE1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATRIPQ8WXE1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATRIPQ8WXE1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ATRIPQ8WXE1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATRIPQ8WXE1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATRIPQ8WXE1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ATRIPQ8WXE1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ATRIPQ8WXE1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATRIPQ8WXE1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATRIPQ8WXE1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATRIPQ8WXE1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ATRIPQ8WXE1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATRIPQ8WXE1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATRIPQ8WXE1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ATRIPQ8WXE1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ATRIPQ8WXE1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ATRIPQ8WXE1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ATRIPQ8WXE1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ATRIPQ8WXE1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ATRIPQ8WXE1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ATRIPQ8WXE1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ATRIPQ8WXE1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ATRIPQ8WXE1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ATRIPQ8WXE1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ATRIPQ8WXE1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATRIPQ8WXE1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ATRIPQ8WXE1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ATRIPQ8WXE1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATRIPQ8WXE1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATRIPQ8WXE1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATRIPQ8WXE1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATRIPQ8WXE1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ATRIPQ8WXE1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATRIPQ8WXE1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATRIPQ8WXE1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATRIPQ8WXE1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATRIPQ8WXE1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATRIPQ8WXE1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATRIPQ8WXE1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATRIPQ8WXE1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATRIPQ8WXE1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATRIPQ8WXE1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATRIPQ8WXE1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ATRIPQ8WXE1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ATRIPQ8WXE1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATRIPQ8WXE1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ATRIPQ8WXE1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ATRIPQ8WXE1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ATRIPQ8WXE1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATRIPQ8WXE1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATRIPQ8WXE1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATRIPQ8WXE1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATRIPQ8WXE1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATRIPQ8WXE1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ATRIPQ8WXE1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 425.3 ms