Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVN6

SECTM1, Secreted and transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SECTM1Q8WVN6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SECTM1Q8WVN6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SECTM1Q8WVN6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SECTM1Q8WVN6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SECTM1Q8WVN6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SECTM1Q8WVN6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SECTM1Q8WVN6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SECTM1Q8WVN6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SECTM1Q8WVN6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SECTM1Q8WVN6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SECTM1Q8WVN6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SECTM1Q8WVN6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SECTM1Q8WVN6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SECTM1Q8WVN6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SECTM1Q8WVN6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SECTM1Q8WVN6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SECTM1Q8WVN6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SECTM1Q8WVN6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SECTM1Q8WVN6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SECTM1Q8WVN6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SECTM1Q8WVN6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SECTM1Q8WVN6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SECTM1Q8WVN6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SECTM1Q8WVN6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SECTM1Q8WVN6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SECTM1Q8WVN6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SECTM1Q8WVN6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SECTM1Q8WVN6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SECTM1Q8WVN6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SECTM1Q8WVN6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SECTM1Q8WVN6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SECTM1Q8WVN6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SECTM1Q8WVN6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SECTM1Q8WVN6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SECTM1Q8WVN6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SECTM1Q8WVN6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SECTM1Q8WVN6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SECTM1Q8WVN6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SECTM1Q8WVN6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SECTM1Q8WVN6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SECTM1Q8WVN6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SECTM1Q8WVN6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SECTM1Q8WVN6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SECTM1Q8WVN6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SECTM1Q8WVN6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SECTM1Q8WVN6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SECTM1Q8WVN6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SECTM1Q8WVN6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SECTM1Q8WVN6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SECTM1Q8WVN6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SECTM1Q8WVN6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SECTM1Q8WVN6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SECTM1Q8WVN6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SECTM1Q8WVN6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SECTM1Q8WVN6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SECTM1Q8WVN6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SECTM1Q8WVN6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SECTM1Q8WVN6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SECTM1Q8WVN6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SECTM1Q8WVN6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SECTM1Q8WVN6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SECTM1Q8WVN6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SECTM1Q8WVN6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SECTM1Q8WVN6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SECTM1Q8WVN6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SECTM1Q8WVN6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SECTM1Q8WVN6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SECTM1Q8WVN6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SECTM1Q8WVN6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SECTM1Q8WVN6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SECTM1Q8WVN6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SECTM1Q8WVN6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SECTM1Q8WVN6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SECTM1Q8WVN6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SECTM1Q8WVN6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SECTM1Q8WVN6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SECTM1Q8WVN6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SECTM1Q8WVN6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SECTM1Q8WVN6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SECTM1Q8WVN6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SECTM1Q8WVN6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SECTM1Q8WVN6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SECTM1Q8WVN6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SECTM1Q8WVN6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SECTM1Q8WVN6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SECTM1Q8WVN6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SECTM1Q8WVN6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SECTM1Q8WVN6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SECTM1Q8WVN6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SECTM1Q8WVN6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SECTM1Q8WVN6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SECTM1Q8WVN6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SECTM1Q8WVN6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SECTM1Q8WVN6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SECTM1Q8WVN6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SECTM1Q8WVN6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SECTM1Q8WVN6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SECTM1Q8WVN6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SECTM1Q8WVN6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SECTM1Q8WVN6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms