Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD6

CHPT1, Cholinephosphotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPT1Q8WUD6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHPT1Q8WUD6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHPT1Q8WUD6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHPT1Q8WUD6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHPT1Q8WUD6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHPT1Q8WUD6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHPT1Q8WUD6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHPT1Q8WUD6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHPT1Q8WUD6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHPT1Q8WUD6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHPT1Q8WUD6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHPT1Q8WUD6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHPT1Q8WUD6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHPT1Q8WUD6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHPT1Q8WUD6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHPT1Q8WUD6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHPT1Q8WUD6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHPT1Q8WUD6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHPT1Q8WUD6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHPT1Q8WUD6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CHPT1Q8WUD6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHPT1Q8WUD6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHPT1Q8WUD6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHPT1Q8WUD6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHPT1Q8WUD6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHPT1Q8WUD6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHPT1Q8WUD6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHPT1Q8WUD6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHPT1Q8WUD6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHPT1Q8WUD6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHPT1Q8WUD6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHPT1Q8WUD6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHPT1Q8WUD6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHPT1Q8WUD6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHPT1Q8WUD6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHPT1Q8WUD6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHPT1Q8WUD6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHPT1Q8WUD6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHPT1Q8WUD6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHPT1Q8WUD6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHPT1Q8WUD6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHPT1Q8WUD6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHPT1Q8WUD6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHPT1Q8WUD6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHPT1Q8WUD6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHPT1Q8WUD6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHPT1Q8WUD6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHPT1Q8WUD6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHPT1Q8WUD6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHPT1Q8WUD6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHPT1Q8WUD6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHPT1Q8WUD6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHPT1Q8WUD6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHPT1Q8WUD6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHPT1Q8WUD6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHPT1Q8WUD6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHPT1Q8WUD6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHPT1Q8WUD6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHPT1Q8WUD6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHPT1Q8WUD6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHPT1Q8WUD6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHPT1Q8WUD6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHPT1Q8WUD6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHPT1Q8WUD6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHPT1Q8WUD6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHPT1Q8WUD6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHPT1Q8WUD6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHPT1Q8WUD6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHPT1Q8WUD6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHPT1Q8WUD6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHPT1Q8WUD6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHPT1Q8WUD6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHPT1Q8WUD6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHPT1Q8WUD6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHPT1Q8WUD6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHPT1Q8WUD6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHPT1Q8WUD6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHPT1Q8WUD6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHPT1Q8WUD6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHPT1Q8WUD6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHPT1Q8WUD6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHPT1Q8WUD6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHPT1Q8WUD6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHPT1Q8WUD6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHPT1Q8WUD6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHPT1Q8WUD6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHPT1Q8WUD6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHPT1Q8WUD6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHPT1Q8WUD6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHPT1Q8WUD6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHPT1Q8WUD6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHPT1Q8WUD6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHPT1Q8WUD6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHPT1Q8WUD6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHPT1Q8WUD6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHPT1Q8WUD6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHPT1Q8WUD6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHPT1Q8WUD6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHPT1Q8WUD6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHPT1Q8WUD6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms