Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MDM1Q8TC05 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MDM1Q8TC05 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MDM1Q8TC05 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MDM1Q8TC05 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MDM1Q8TC05 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MDM1Q8TC05 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MDM1Q8TC05 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MDM1Q8TC05 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MDM1Q8TC05 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MDM1Q8TC05 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
MDM1Q8TC05 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MDM1Q8TC05 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MDM1Q8TC05 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MDM1Q8TC05 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MDM1Q8TC05 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MDM1Q8TC05 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MDM1Q8TC05 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MDM1Q8TC05 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MDM1Q8TC05 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MDM1Q8TC05 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MDM1Q8TC05 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MDM1Q8TC05 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MDM1Q8TC05 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MDM1Q8TC05 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MDM1Q8TC05 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MDM1Q8TC05 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MDM1Q8TC05 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MDM1Q8TC05 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MDM1Q8TC05 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MDM1Q8TC05 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MDM1Q8TC05 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MDM1Q8TC05 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MDM1Q8TC05 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MDM1Q8TC05 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MDM1Q8TC05 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MDM1Q8TC05 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MDM1Q8TC05 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MDM1Q8TC05 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MDM1Q8TC05 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MDM1Q8TC05 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MDM1Q8TC05 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MDM1Q8TC05 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MDM1Q8TC05 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MDM1Q8TC05 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MDM1Q8TC05 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MDM1Q8TC05 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
MDM1Q8TC05 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MDM1Q8TC05 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MDM1Q8TC05 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MDM1Q8TC05 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MDM1Q8TC05 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MDM1Q8TC05 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MDM1Q8TC05 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MDM1Q8TC05 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MDM1Q8TC05 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MDM1Q8TC05 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MDM1Q8TC05 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MDM1Q8TC05 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MDM1Q8TC05 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MDM1Q8TC05 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MDM1Q8TC05 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MDM1Q8TC05 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MDM1Q8TC05 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
MDM1Q8TC05 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MDM1Q8TC05 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MDM1Q8TC05 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MDM1Q8TC05 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MDM1Q8TC05 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MDM1Q8TC05 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MDM1Q8TC05 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MDM1Q8TC05 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MDM1Q8TC05 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MDM1Q8TC05 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MDM1Q8TC05 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MDM1Q8TC05 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MDM1Q8TC05 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MDM1Q8TC05 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MDM1Q8TC05 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MDM1Q8TC05 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MDM1Q8TC05 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MDM1Q8TC05 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MDM1Q8TC05 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MDM1Q8TC05 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MDM1Q8TC05 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MDM1Q8TC05 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MDM1Q8TC05 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MDM1Q8TC05 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MDM1Q8TC05 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MDM1Q8TC05 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MDM1Q8TC05 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MDM1Q8TC05 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MDM1Q8TC05 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MDM1Q8TC05 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MDM1Q8TC05 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MDM1Q8TC05 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MDM1Q8TC05 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MDM1Q8TC05 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MDM1Q8TC05 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MDM1Q8TC05 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms