Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM1BQ8NB78 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM1BQ8NB78 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM1BQ8NB78 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM1BQ8NB78 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM1BQ8NB78 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM1BQ8NB78 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM1BQ8NB78 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM1BQ8NB78 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM1BQ8NB78 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM1BQ8NB78 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM1BQ8NB78 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM1BQ8NB78 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM1BQ8NB78 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM1BQ8NB78 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM1BQ8NB78 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
KDM1BQ8NB78 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM1BQ8NB78 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM1BQ8NB78 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM1BQ8NB78 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM1BQ8NB78 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM1BQ8NB78 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM1BQ8NB78 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM1BQ8NB78 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM1BQ8NB78 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM1BQ8NB78 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM1BQ8NB78 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM1BQ8NB78 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM1BQ8NB78 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM1BQ8NB78 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM1BQ8NB78 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM1BQ8NB78 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM1BQ8NB78 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM1BQ8NB78 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM1BQ8NB78 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM1BQ8NB78 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM1BQ8NB78 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM1BQ8NB78 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM1BQ8NB78 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM1BQ8NB78 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM1BQ8NB78 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM1BQ8NB78 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM1BQ8NB78 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM1BQ8NB78 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM1BQ8NB78 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM1BQ8NB78 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM1BQ8NB78 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM1BQ8NB78 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM1BQ8NB78 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM1BQ8NB78 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM1BQ8NB78 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM1BQ8NB78 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM1BQ8NB78 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM1BQ8NB78 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM1BQ8NB78 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KDM1BQ8NB78 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM1BQ8NB78 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM1BQ8NB78 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM1BQ8NB78 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM1BQ8NB78 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM1BQ8NB78 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM1BQ8NB78 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM1BQ8NB78 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM1BQ8NB78 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM1BQ8NB78 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM1BQ8NB78 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM1BQ8NB78 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM1BQ8NB78 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM1BQ8NB78 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM1BQ8NB78 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM1BQ8NB78 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM1BQ8NB78 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM1BQ8NB78 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM1BQ8NB78 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM1BQ8NB78 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM1BQ8NB78 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM1BQ8NB78 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM1BQ8NB78 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KDM1BQ8NB78 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KDM1BQ8NB78 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KDM1BQ8NB78 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KDM1BQ8NB78 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM1BQ8NB78 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM1BQ8NB78 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM1BQ8NB78 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM1BQ8NB78 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM1BQ8NB78 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM1BQ8NB78 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM1BQ8NB78 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM1BQ8NB78 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM1BQ8NB78 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM1BQ8NB78 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM1BQ8NB78 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM1BQ8NB78 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM1BQ8NB78 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM1BQ8NB78 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM1BQ8NB78 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM1BQ8NB78 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM1BQ8NB78 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM1BQ8NB78 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms