Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB12

SMYD1, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD1, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD1Q8NB12 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMYD1Q8NB12 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMYD1Q8NB12 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMYD1Q8NB12 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMYD1Q8NB12 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMYD1Q8NB12 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMYD1Q8NB12 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMYD1Q8NB12 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMYD1Q8NB12 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMYD1Q8NB12 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMYD1Q8NB12 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SMYD1Q8NB12 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMYD1Q8NB12 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMYD1Q8NB12 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMYD1Q8NB12 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SMYD1Q8NB12 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMYD1Q8NB12 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMYD1Q8NB12 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMYD1Q8NB12 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMYD1Q8NB12 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMYD1Q8NB12 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMYD1Q8NB12 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMYD1Q8NB12 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMYD1Q8NB12 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMYD1Q8NB12 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMYD1Q8NB12 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMYD1Q8NB12 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMYD1Q8NB12 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SMYD1Q8NB12 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMYD1Q8NB12 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMYD1Q8NB12 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMYD1Q8NB12 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMYD1Q8NB12 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMYD1Q8NB12 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMYD1Q8NB12 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMYD1Q8NB12 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMYD1Q8NB12 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMYD1Q8NB12 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMYD1Q8NB12 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMYD1Q8NB12 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMYD1Q8NB12 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMYD1Q8NB12 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMYD1Q8NB12 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMYD1Q8NB12 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMYD1Q8NB12 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMYD1Q8NB12 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMYD1Q8NB12 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMYD1Q8NB12 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMYD1Q8NB12 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SMYD1Q8NB12 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMYD1Q8NB12 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMYD1Q8NB12 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMYD1Q8NB12 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMYD1Q8NB12 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMYD1Q8NB12 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMYD1Q8NB12 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMYD1Q8NB12 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMYD1Q8NB12 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMYD1Q8NB12 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMYD1Q8NB12 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMYD1Q8NB12 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SMYD1Q8NB12 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMYD1Q8NB12 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMYD1Q8NB12 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMYD1Q8NB12 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMYD1Q8NB12 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMYD1Q8NB12 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMYD1Q8NB12 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMYD1Q8NB12 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMYD1Q8NB12 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMYD1Q8NB12 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMYD1Q8NB12 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SMYD1Q8NB12 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMYD1Q8NB12 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMYD1Q8NB12 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMYD1Q8NB12 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMYD1Q8NB12 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMYD1Q8NB12 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMYD1Q8NB12 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMYD1Q8NB12 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMYD1Q8NB12 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMYD1Q8NB12 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMYD1Q8NB12 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMYD1Q8NB12 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMYD1Q8NB12 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMYD1Q8NB12 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMYD1Q8NB12 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMYD1Q8NB12 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMYD1Q8NB12 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMYD1Q8NB12 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMYD1Q8NB12 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMYD1Q8NB12 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMYD1Q8NB12 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMYD1Q8NB12 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMYD1Q8NB12 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMYD1Q8NB12 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMYD1Q8NB12 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMYD1Q8NB12 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMYD1Q8NB12 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMYD1Q8NB12 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms