Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7P3

CLDN22, Claudin-22, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN22Q8N7P3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLDN22Q8N7P3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLDN22Q8N7P3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLDN22Q8N7P3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLDN22Q8N7P3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLDN22Q8N7P3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLDN22Q8N7P3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLDN22Q8N7P3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLDN22Q8N7P3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLDN22Q8N7P3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLDN22Q8N7P3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CLDN22Q8N7P3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLDN22Q8N7P3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLDN22Q8N7P3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLDN22Q8N7P3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLDN22Q8N7P3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLDN22Q8N7P3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLDN22Q8N7P3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLDN22Q8N7P3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLDN22Q8N7P3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLDN22Q8N7P3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLDN22Q8N7P3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLDN22Q8N7P3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLDN22Q8N7P3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLDN22Q8N7P3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLDN22Q8N7P3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN22Q8N7P3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN22Q8N7P3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLDN22Q8N7P3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN22Q8N7P3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN22Q8N7P3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDN22Q8N7P3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN22Q8N7P3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN22Q8N7P3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN22Q8N7P3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN22Q8N7P3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDN22Q8N7P3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDN22Q8N7P3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDN22Q8N7P3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN22Q8N7P3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN22Q8N7P3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN22Q8N7P3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN22Q8N7P3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN22Q8N7P3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN22Q8N7P3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN22Q8N7P3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN22Q8N7P3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN22Q8N7P3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN22Q8N7P3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN22Q8N7P3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN22Q8N7P3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN22Q8N7P3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN22Q8N7P3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN22Q8N7P3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN22Q8N7P3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN22Q8N7P3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN22Q8N7P3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN22Q8N7P3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN22Q8N7P3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN22Q8N7P3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN22Q8N7P3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN22Q8N7P3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLDN22Q8N7P3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN22Q8N7P3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN22Q8N7P3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN22Q8N7P3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLDN22Q8N7P3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLDN22Q8N7P3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLDN22Q8N7P3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN22Q8N7P3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN22Q8N7P3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN22Q8N7P3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN22Q8N7P3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN22Q8N7P3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN22Q8N7P3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN22Q8N7P3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN22Q8N7P3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN22Q8N7P3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN22Q8N7P3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN22Q8N7P3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN22Q8N7P3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN22Q8N7P3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN22Q8N7P3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN22Q8N7P3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN22Q8N7P3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN22Q8N7P3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN22Q8N7P3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN22Q8N7P3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN22Q8N7P3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN22Q8N7P3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN22Q8N7P3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN22Q8N7P3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN22Q8N7P3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN22Q8N7P3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN22Q8N7P3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN22Q8N7P3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN22Q8N7P3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN22Q8N7P3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN22Q8N7P3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN22Q8N7P3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms