Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C10orf53Q8N6V4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C10orf53Q8N6V4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C10orf53Q8N6V4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C10orf53Q8N6V4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C10orf53Q8N6V4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C10orf53Q8N6V4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C10orf53Q8N6V4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C10orf53Q8N6V4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C10orf53Q8N6V4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C10orf53Q8N6V4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C10orf53Q8N6V4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
C10orf53Q8N6V4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C10orf53Q8N6V4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C10orf53Q8N6V4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C10orf53Q8N6V4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C10orf53Q8N6V4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C10orf53Q8N6V4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C10orf53Q8N6V4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C10orf53Q8N6V4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
C10orf53Q8N6V4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C10orf53Q8N6V4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C10orf53Q8N6V4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C10orf53Q8N6V4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C10orf53Q8N6V4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C10orf53Q8N6V4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C10orf53Q8N6V4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C10orf53Q8N6V4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C10orf53Q8N6V4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C10orf53Q8N6V4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C10orf53Q8N6V4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C10orf53Q8N6V4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C10orf53Q8N6V4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C10orf53Q8N6V4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C10orf53Q8N6V4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C10orf53Q8N6V4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C10orf53Q8N6V4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C10orf53Q8N6V4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C10orf53Q8N6V4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
C10orf53Q8N6V4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
C10orf53Q8N6V4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
C10orf53Q8N6V4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C10orf53Q8N6V4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
C10orf53Q8N6V4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C10orf53Q8N6V4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C10orf53Q8N6V4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C10orf53Q8N6V4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C10orf53Q8N6V4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C10orf53Q8N6V4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C10orf53Q8N6V4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C10orf53Q8N6V4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C10orf53Q8N6V4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C10orf53Q8N6V4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C10orf53Q8N6V4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C10orf53Q8N6V4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C10orf53Q8N6V4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C10orf53Q8N6V4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C10orf53Q8N6V4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C10orf53Q8N6V4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C10orf53Q8N6V4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C10orf53Q8N6V4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C10orf53Q8N6V4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C10orf53Q8N6V4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C10orf53Q8N6V4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C10orf53Q8N6V4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C10orf53Q8N6V4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C10orf53Q8N6V4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C10orf53Q8N6V4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C10orf53Q8N6V4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C10orf53Q8N6V4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C10orf53Q8N6V4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C10orf53Q8N6V4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C10orf53Q8N6V4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C10orf53Q8N6V4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C10orf53Q8N6V4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C10orf53Q8N6V4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C10orf53Q8N6V4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C10orf53Q8N6V4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C10orf53Q8N6V4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C10orf53Q8N6V4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C10orf53Q8N6V4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C10orf53Q8N6V4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C10orf53Q8N6V4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C10orf53Q8N6V4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C10orf53Q8N6V4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C10orf53Q8N6V4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C10orf53Q8N6V4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C10orf53Q8N6V4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C10orf53Q8N6V4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C10orf53Q8N6V4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C10orf53Q8N6V4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C10orf53Q8N6V4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C10orf53Q8N6V4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C10orf53Q8N6V4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C10orf53Q8N6V4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C10orf53Q8N6V4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C10orf53Q8N6V4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C10orf53Q8N6V4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C10orf53Q8N6V4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C10orf53Q8N6V4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms