Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM20Q8N5G0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM20Q8N5G0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM20Q8N5G0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM20Q8N5G0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM20Q8N5G0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM20Q8N5G0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM20Q8N5G0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM20Q8N5G0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM20Q8N5G0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMIM20Q8N5G0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM20Q8N5G0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM20Q8N5G0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM20Q8N5G0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM20Q8N5G0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM20Q8N5G0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM20Q8N5G0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM20Q8N5G0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM20Q8N5G0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM20Q8N5G0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM20Q8N5G0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM20Q8N5G0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM20Q8N5G0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM20Q8N5G0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM20Q8N5G0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM20Q8N5G0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM20Q8N5G0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM20Q8N5G0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM20Q8N5G0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM20Q8N5G0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM20Q8N5G0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM20Q8N5G0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM20Q8N5G0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM20Q8N5G0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM20Q8N5G0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM20Q8N5G0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM20Q8N5G0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM20Q8N5G0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM20Q8N5G0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM20Q8N5G0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM20Q8N5G0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM20Q8N5G0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM20Q8N5G0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM20Q8N5G0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM20Q8N5G0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM20Q8N5G0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM20Q8N5G0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM20Q8N5G0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM20Q8N5G0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM20Q8N5G0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM20Q8N5G0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM20Q8N5G0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM20Q8N5G0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM20Q8N5G0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM20Q8N5G0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM20Q8N5G0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM20Q8N5G0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM20Q8N5G0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM20Q8N5G0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM20Q8N5G0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM20Q8N5G0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM20Q8N5G0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM20Q8N5G0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM20Q8N5G0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM20Q8N5G0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM20Q8N5G0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM20Q8N5G0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM20Q8N5G0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM20Q8N5G0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM20Q8N5G0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM20Q8N5G0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM20Q8N5G0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM20Q8N5G0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM20Q8N5G0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM20Q8N5G0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM20Q8N5G0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM20Q8N5G0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM20Q8N5G0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM20Q8N5G0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM20Q8N5G0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM20Q8N5G0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM20Q8N5G0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM20Q8N5G0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM20Q8N5G0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM20Q8N5G0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM20Q8N5G0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM20Q8N5G0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM20Q8N5G0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM20Q8N5G0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM20Q8N5G0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM20Q8N5G0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM20Q8N5G0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM20Q8N5G0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM20Q8N5G0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM20Q8N5G0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM20Q8N5G0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM20Q8N5G0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM20Q8N5G0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM20Q8N5G0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM20Q8N5G0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms