Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMPRSS6Q8IU80 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMPRSS6Q8IU80 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMPRSS6Q8IU80 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMPRSS6Q8IU80 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMPRSS6Q8IU80 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
TMPRSS6Q8IU80 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMPRSS6Q8IU80 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMPRSS6Q8IU80 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMPRSS6Q8IU80 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMPRSS6Q8IU80 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMPRSS6Q8IU80 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMPRSS6Q8IU80 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMPRSS6Q8IU80 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMPRSS6Q8IU80 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMPRSS6Q8IU80 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMPRSS6Q8IU80 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMPRSS6Q8IU80 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMPRSS6Q8IU80 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMPRSS6Q8IU80 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TMPRSS6Q8IU80 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMPRSS6Q8IU80 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMPRSS6Q8IU80 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMPRSS6Q8IU80 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMPRSS6Q8IU80 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMPRSS6Q8IU80 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMPRSS6Q8IU80 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMPRSS6Q8IU80 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMPRSS6Q8IU80 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMPRSS6Q8IU80 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMPRSS6Q8IU80 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMPRSS6Q8IU80 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMPRSS6Q8IU80 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMPRSS6Q8IU80 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMPRSS6Q8IU80 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMPRSS6Q8IU80 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMPRSS6Q8IU80 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMPRSS6Q8IU80 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMPRSS6Q8IU80 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMPRSS6Q8IU80 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMPRSS6Q8IU80 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMPRSS6Q8IU80 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TMPRSS6Q8IU80 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMPRSS6Q8IU80 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMPRSS6Q8IU80 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMPRSS6Q8IU80 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMPRSS6Q8IU80 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMPRSS6Q8IU80 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMPRSS6Q8IU80 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMPRSS6Q8IU80 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMPRSS6Q8IU80 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMPRSS6Q8IU80 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMPRSS6Q8IU80 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMPRSS6Q8IU80 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMPRSS6Q8IU80 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMPRSS6Q8IU80 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TMPRSS6Q8IU80 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMPRSS6Q8IU80 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMPRSS6Q8IU80 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TMPRSS6Q8IU80 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMPRSS6Q8IU80 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMPRSS6Q8IU80 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMPRSS6Q8IU80 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMPRSS6Q8IU80 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMPRSS6Q8IU80 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMPRSS6Q8IU80 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMPRSS6Q8IU80 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMPRSS6Q8IU80 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMPRSS6Q8IU80 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMPRSS6Q8IU80 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMPRSS6Q8IU80 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMPRSS6Q8IU80 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMPRSS6Q8IU80 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMPRSS6Q8IU80 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMPRSS6Q8IU80 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMPRSS6Q8IU80 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMPRSS6Q8IU80 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMPRSS6Q8IU80 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMPRSS6Q8IU80 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TMPRSS6Q8IU80 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMPRSS6Q8IU80 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMPRSS6Q8IU80 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMPRSS6Q8IU80 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMPRSS6Q8IU80 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TMPRSS6Q8IU80 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMPRSS6Q8IU80 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TMPRSS6Q8IU80 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMPRSS6Q8IU80 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMPRSS6Q8IU80 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMPRSS6Q8IU80 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMPRSS6Q8IU80 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMPRSS6Q8IU80 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMPRSS6Q8IU80 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMPRSS6Q8IU80 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMPRSS6Q8IU80 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TMPRSS6Q8IU80 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMPRSS6Q8IU80 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMPRSS6Q8IU80 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMPRSS6Q8IU80 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMPRSS6Q8IU80 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms