Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
IFNL1Q8IU54 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
IFNL1Q8IU54 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
IFNL1Q8IU54 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
IFNL1Q8IU54 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
IFNL1Q8IU54 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
IFNL1Q8IU54 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
IFNL1Q8IU54 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
IFNL1Q8IU54 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
IFNL1Q8IU54 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
IFNL1Q8IU54 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
IFNL1Q8IU54 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
IFNL1Q8IU54 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
IFNL1Q8IU54 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
IFNL1Q8IU54 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
IFNL1Q8IU54 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
IFNL1Q8IU54 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
IFNL1Q8IU54 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
IFNL1Q8IU54 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
IFNL1Q8IU54 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
IFNL1Q8IU54 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
IFNL1Q8IU54 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
IFNL1Q8IU54 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
IFNL1Q8IU54 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
IFNL1Q8IU54 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
IFNL1Q8IU54 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
IFNL1Q8IU54 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
IFNL1Q8IU54 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
IFNL1Q8IU54 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
IFNL1Q8IU54 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
IFNL1Q8IU54 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
IFNL1Q8IU54 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
IFNL1Q8IU54 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
IFNL1Q8IU54 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
IFNL1Q8IU54 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
IFNL1Q8IU54 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
IFNL1Q8IU54 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
IFNL1Q8IU54 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
IFNL1Q8IU54 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
IFNL1Q8IU54 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
IFNL1Q8IU54 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
IFNL1Q8IU54 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
IFNL1Q8IU54 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
IFNL1Q8IU54 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
IFNL1Q8IU54 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
IFNL1Q8IU54 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
IFNL1Q8IU54 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
IFNL1Q8IU54 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
IFNL1Q8IU54 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
IFNL1Q8IU54 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
IFNL1Q8IU54 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
IFNL1Q8IU54 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
IFNL1Q8IU54 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
IFNL1Q8IU54 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
IFNL1Q8IU54 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
IFNL1Q8IU54 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
IFNL1Q8IU54 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
IFNL1Q8IU54 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
IFNL1Q8IU54 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
IFNL1Q8IU54 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
IFNL1Q8IU54 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
IFNL1Q8IU54 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
IFNL1Q8IU54 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
IFNL1Q8IU54 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
IFNL1Q8IU54 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
IFNL1Q8IU54 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
IFNL1Q8IU54 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
IFNL1Q8IU54 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
IFNL1Q8IU54 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
IFNL1Q8IU54 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
IFNL1Q8IU54 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
IFNL1Q8IU54 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
IFNL1Q8IU54 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
IFNL1Q8IU54 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
IFNL1Q8IU54 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
IFNL1Q8IU54 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
IFNL1Q8IU54 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
IFNL1Q8IU54 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
IFNL1Q8IU54 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
IFNL1Q8IU54 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
IFNL1Q8IU54 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
IFNL1Q8IU54 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
IFNL1Q8IU54 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
IFNL1Q8IU54 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
IFNL1Q8IU54 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
IFNL1Q8IU54 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
IFNL1Q8IU54 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
IFNL1Q8IU54 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
IFNL1Q8IU54 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
IFNL1Q8IU54 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
IFNL1Q8IU54 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
IFNL1Q8IU54 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
IFNL1Q8IU54 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
IFNL1Q8IU54 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
IFNL1Q8IU54 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
IFNL1Q8IU54 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
IFNL1Q8IU54 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
IFNL1Q8IU54 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
IFNL1Q8IU54 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
IFNL1Q8IU54 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms