Protein–RNA interactions for Protein: Q86X29

LSR, Lipolysis-stimulated lipoprotein receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSRQ86X29 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LSRQ86X29 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LSRQ86X29 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LSRQ86X29 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LSRQ86X29 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LSRQ86X29 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LSRQ86X29 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LSRQ86X29 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LSRQ86X29 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LSRQ86X29 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LSRQ86X29 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LSRQ86X29 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LSRQ86X29 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LSRQ86X29 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LSRQ86X29 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LSRQ86X29 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LSRQ86X29 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LSRQ86X29 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LSRQ86X29 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LSRQ86X29 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LSRQ86X29 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LSRQ86X29 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LSRQ86X29 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LSRQ86X29 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LSRQ86X29 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LSRQ86X29 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LSRQ86X29 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LSRQ86X29 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LSRQ86X29 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LSRQ86X29 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LSRQ86X29 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LSRQ86X29 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LSRQ86X29 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LSRQ86X29 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LSRQ86X29 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LSRQ86X29 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LSRQ86X29 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LSRQ86X29 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LSRQ86X29 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LSRQ86X29 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LSRQ86X29 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LSRQ86X29 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LSRQ86X29 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LSRQ86X29 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LSRQ86X29 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LSRQ86X29 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSRQ86X29 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSRQ86X29 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSRQ86X29 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LSRQ86X29 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LSRQ86X29 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LSRQ86X29 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LSRQ86X29 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LSRQ86X29 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LSRQ86X29 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LSRQ86X29 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
LSRQ86X29 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LSRQ86X29 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LSRQ86X29 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LSRQ86X29 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LSRQ86X29 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LSRQ86X29 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LSRQ86X29 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LSRQ86X29 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LSRQ86X29 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LSRQ86X29 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LSRQ86X29 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LSRQ86X29 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LSRQ86X29 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LSRQ86X29 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LSRQ86X29 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LSRQ86X29 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LSRQ86X29 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LSRQ86X29 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LSRQ86X29 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LSRQ86X29 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LSRQ86X29 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LSRQ86X29 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LSRQ86X29 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LSRQ86X29 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LSRQ86X29 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LSRQ86X29 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LSRQ86X29 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LSRQ86X29 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LSRQ86X29 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LSRQ86X29 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LSRQ86X29 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LSRQ86X29 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LSRQ86X29 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LSRQ86X29 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LSRQ86X29 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LSRQ86X29 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LSRQ86X29 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LSRQ86X29 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LSRQ86X29 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LSRQ86X29 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LSRQ86X29 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LSRQ86X29 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LSRQ86X29 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LSRQ86X29 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms