Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF554Q86TJ5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF554Q86TJ5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF554Q86TJ5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF554Q86TJ5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF554Q86TJ5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF554Q86TJ5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF554Q86TJ5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF554Q86TJ5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF554Q86TJ5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF554Q86TJ5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF554Q86TJ5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF554Q86TJ5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF554Q86TJ5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZNF554Q86TJ5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF554Q86TJ5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF554Q86TJ5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF554Q86TJ5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF554Q86TJ5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF554Q86TJ5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF554Q86TJ5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF554Q86TJ5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF554Q86TJ5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF554Q86TJ5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF554Q86TJ5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF554Q86TJ5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF554Q86TJ5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF554Q86TJ5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF554Q86TJ5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF554Q86TJ5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF554Q86TJ5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF554Q86TJ5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF554Q86TJ5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF554Q86TJ5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF554Q86TJ5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF554Q86TJ5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF554Q86TJ5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF554Q86TJ5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF554Q86TJ5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF554Q86TJ5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF554Q86TJ5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF554Q86TJ5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF554Q86TJ5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF554Q86TJ5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF554Q86TJ5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF554Q86TJ5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF554Q86TJ5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF554Q86TJ5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF554Q86TJ5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF554Q86TJ5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF554Q86TJ5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF554Q86TJ5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF554Q86TJ5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF554Q86TJ5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF554Q86TJ5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF554Q86TJ5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF554Q86TJ5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF554Q86TJ5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF554Q86TJ5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF554Q86TJ5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF554Q86TJ5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF554Q86TJ5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF554Q86TJ5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF554Q86TJ5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF554Q86TJ5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF554Q86TJ5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF554Q86TJ5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF554Q86TJ5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF554Q86TJ5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF554Q86TJ5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF554Q86TJ5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF554Q86TJ5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF554Q86TJ5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF554Q86TJ5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF554Q86TJ5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF554Q86TJ5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF554Q86TJ5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF554Q86TJ5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF554Q86TJ5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF554Q86TJ5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF554Q86TJ5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF554Q86TJ5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF554Q86TJ5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF554Q86TJ5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF554Q86TJ5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF554Q86TJ5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF554Q86TJ5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF554Q86TJ5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF554Q86TJ5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF554Q86TJ5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF554Q86TJ5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF554Q86TJ5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF554Q86TJ5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF554Q86TJ5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF554Q86TJ5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF554Q86TJ5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF554Q86TJ5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF554Q86TJ5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF554Q86TJ5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF554Q86TJ5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms