Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6G3

NECAB2, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAB2Q7Z6G3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NECAB2Q7Z6G3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NECAB2Q7Z6G3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NECAB2Q7Z6G3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NECAB2Q7Z6G3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
NECAB2Q7Z6G3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NECAB2Q7Z6G3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NECAB2Q7Z6G3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NECAB2Q7Z6G3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NECAB2Q7Z6G3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NECAB2Q7Z6G3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NECAB2Q7Z6G3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
NECAB2Q7Z6G3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33■■■□□ 2.87
NECAB2Q7Z6G3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NECAB2Q7Z6G3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NECAB2Q7Z6G3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NECAB2Q7Z6G3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NECAB2Q7Z6G3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NECAB2Q7Z6G3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
NECAB2Q7Z6G3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NECAB2Q7Z6G3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
NECAB2Q7Z6G3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NECAB2Q7Z6G3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
NECAB2Q7Z6G3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NECAB2Q7Z6G3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NECAB2Q7Z6G3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NECAB2Q7Z6G3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NECAB2Q7Z6G3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NECAB2Q7Z6G3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NECAB2Q7Z6G3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NECAB2Q7Z6G3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NECAB2Q7Z6G3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NECAB2Q7Z6G3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NECAB2Q7Z6G3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NECAB2Q7Z6G3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NECAB2Q7Z6G3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NECAB2Q7Z6G3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NECAB2Q7Z6G3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NECAB2Q7Z6G3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NECAB2Q7Z6G3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NECAB2Q7Z6G3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NECAB2Q7Z6G3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NECAB2Q7Z6G3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NECAB2Q7Z6G3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NECAB2Q7Z6G3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NECAB2Q7Z6G3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NECAB2Q7Z6G3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NECAB2Q7Z6G3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NECAB2Q7Z6G3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NECAB2Q7Z6G3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NECAB2Q7Z6G3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NECAB2Q7Z6G3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NECAB2Q7Z6G3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NECAB2Q7Z6G3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NECAB2Q7Z6G3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NECAB2Q7Z6G3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NECAB2Q7Z6G3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NECAB2Q7Z6G3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NECAB2Q7Z6G3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NECAB2Q7Z6G3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
NECAB2Q7Z6G3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NECAB2Q7Z6G3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NECAB2Q7Z6G3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NECAB2Q7Z6G3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NECAB2Q7Z6G3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NECAB2Q7Z6G3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
NECAB2Q7Z6G3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
NECAB2Q7Z6G3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NECAB2Q7Z6G3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NECAB2Q7Z6G3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NECAB2Q7Z6G3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NECAB2Q7Z6G3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NECAB2Q7Z6G3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NECAB2Q7Z6G3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NECAB2Q7Z6G3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NECAB2Q7Z6G3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
NECAB2Q7Z6G3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NECAB2Q7Z6G3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NECAB2Q7Z6G3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NECAB2Q7Z6G3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NECAB2Q7Z6G3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NECAB2Q7Z6G3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NECAB2Q7Z6G3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NECAB2Q7Z6G3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
NECAB2Q7Z6G3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NECAB2Q7Z6G3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NECAB2Q7Z6G3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32■■■□□ 2.71
NECAB2Q7Z6G3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NECAB2Q7Z6G3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NECAB2Q7Z6G3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NECAB2Q7Z6G3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
NECAB2Q7Z6G3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NECAB2Q7Z6G3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NECAB2Q7Z6G3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NECAB2Q7Z6G3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NECAB2Q7Z6G3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NECAB2Q7Z6G3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NECAB2Q7Z6G3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NECAB2Q7Z6G3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NECAB2Q7Z6G3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms