Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5L0

VMO1, Vitelline membrane outer layer protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMO1Q7Z5L0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VMO1Q7Z5L0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VMO1Q7Z5L0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VMO1Q7Z5L0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VMO1Q7Z5L0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VMO1Q7Z5L0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VMO1Q7Z5L0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VMO1Q7Z5L0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VMO1Q7Z5L0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VMO1Q7Z5L0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VMO1Q7Z5L0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VMO1Q7Z5L0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VMO1Q7Z5L0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VMO1Q7Z5L0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VMO1Q7Z5L0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VMO1Q7Z5L0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VMO1Q7Z5L0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VMO1Q7Z5L0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VMO1Q7Z5L0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VMO1Q7Z5L0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VMO1Q7Z5L0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VMO1Q7Z5L0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VMO1Q7Z5L0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VMO1Q7Z5L0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VMO1Q7Z5L0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VMO1Q7Z5L0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VMO1Q7Z5L0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VMO1Q7Z5L0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VMO1Q7Z5L0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VMO1Q7Z5L0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VMO1Q7Z5L0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VMO1Q7Z5L0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VMO1Q7Z5L0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VMO1Q7Z5L0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VMO1Q7Z5L0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VMO1Q7Z5L0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VMO1Q7Z5L0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VMO1Q7Z5L0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VMO1Q7Z5L0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VMO1Q7Z5L0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VMO1Q7Z5L0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VMO1Q7Z5L0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VMO1Q7Z5L0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VMO1Q7Z5L0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VMO1Q7Z5L0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VMO1Q7Z5L0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VMO1Q7Z5L0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VMO1Q7Z5L0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VMO1Q7Z5L0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VMO1Q7Z5L0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VMO1Q7Z5L0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VMO1Q7Z5L0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VMO1Q7Z5L0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VMO1Q7Z5L0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VMO1Q7Z5L0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VMO1Q7Z5L0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VMO1Q7Z5L0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VMO1Q7Z5L0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VMO1Q7Z5L0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VMO1Q7Z5L0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VMO1Q7Z5L0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VMO1Q7Z5L0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VMO1Q7Z5L0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VMO1Q7Z5L0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VMO1Q7Z5L0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VMO1Q7Z5L0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VMO1Q7Z5L0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VMO1Q7Z5L0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VMO1Q7Z5L0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VMO1Q7Z5L0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VMO1Q7Z5L0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VMO1Q7Z5L0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VMO1Q7Z5L0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VMO1Q7Z5L0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VMO1Q7Z5L0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VMO1Q7Z5L0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VMO1Q7Z5L0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VMO1Q7Z5L0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VMO1Q7Z5L0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VMO1Q7Z5L0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VMO1Q7Z5L0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VMO1Q7Z5L0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VMO1Q7Z5L0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VMO1Q7Z5L0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VMO1Q7Z5L0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VMO1Q7Z5L0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VMO1Q7Z5L0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VMO1Q7Z5L0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VMO1Q7Z5L0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VMO1Q7Z5L0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VMO1Q7Z5L0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VMO1Q7Z5L0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VMO1Q7Z5L0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VMO1Q7Z5L0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VMO1Q7Z5L0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VMO1Q7Z5L0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VMO1Q7Z5L0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VMO1Q7Z5L0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VMO1Q7Z5L0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VMO1Q7Z5L0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms