Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRC55Q6ZSA7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRC55Q6ZSA7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRC55Q6ZSA7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRC55Q6ZSA7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRC55Q6ZSA7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRC55Q6ZSA7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRC55Q6ZSA7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRC55Q6ZSA7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRC55Q6ZSA7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
LRRC55Q6ZSA7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LRRC55Q6ZSA7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LRRC55Q6ZSA7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LRRC55Q6ZSA7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
LRRC55Q6ZSA7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
LRRC55Q6ZSA7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
LRRC55Q6ZSA7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
LRRC55Q6ZSA7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
LRRC55Q6ZSA7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
LRRC55Q6ZSA7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
LRRC55Q6ZSA7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
LRRC55Q6ZSA7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
LRRC55Q6ZSA7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
LRRC55Q6ZSA7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
LRRC55Q6ZSA7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
LRRC55Q6ZSA7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
LRRC55Q6ZSA7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
LRRC55Q6ZSA7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
LRRC55Q6ZSA7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
LRRC55Q6ZSA7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
LRRC55Q6ZSA7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
LRRC55Q6ZSA7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
LRRC55Q6ZSA7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
LRRC55Q6ZSA7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
LRRC55Q6ZSA7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
LRRC55Q6ZSA7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
LRRC55Q6ZSA7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
LRRC55Q6ZSA7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LRRC55Q6ZSA7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LRRC55Q6ZSA7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LRRC55Q6ZSA7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRC55Q6ZSA7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRC55Q6ZSA7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LRRC55Q6ZSA7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LRRC55Q6ZSA7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LRRC55Q6ZSA7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LRRC55Q6ZSA7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
LRRC55Q6ZSA7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRC55Q6ZSA7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRC55Q6ZSA7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRC55Q6ZSA7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRC55Q6ZSA7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
LRRC55Q6ZSA7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
LRRC55Q6ZSA7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
LRRC55Q6ZSA7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
LRRC55Q6ZSA7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
LRRC55Q6ZSA7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
LRRC55Q6ZSA7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
LRRC55Q6ZSA7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
LRRC55Q6ZSA7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
LRRC55Q6ZSA7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
LRRC55Q6ZSA7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
LRRC55Q6ZSA7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
LRRC55Q6ZSA7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
LRRC55Q6ZSA7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
LRRC55Q6ZSA7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
LRRC55Q6ZSA7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
LRRC55Q6ZSA7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
LRRC55Q6ZSA7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
LRRC55Q6ZSA7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
LRRC55Q6ZSA7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
LRRC55Q6ZSA7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
LRRC55Q6ZSA7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
LRRC55Q6ZSA7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LRRC55Q6ZSA7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LRRC55Q6ZSA7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LRRC55Q6ZSA7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LRRC55Q6ZSA7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
LRRC55Q6ZSA7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
LRRC55Q6ZSA7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
LRRC55Q6ZSA7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
LRRC55Q6ZSA7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
LRRC55Q6ZSA7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
LRRC55Q6ZSA7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
LRRC55Q6ZSA7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
LRRC55Q6ZSA7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LRRC55Q6ZSA7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
LRRC55Q6ZSA7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
LRRC55Q6ZSA7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
LRRC55Q6ZSA7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
LRRC55Q6ZSA7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRC55Q6ZSA7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRC55Q6ZSA7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRC55Q6ZSA7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRC55Q6ZSA7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LRRC55Q6ZSA7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LRRC55Q6ZSA7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LRRC55Q6ZSA7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LRRC55Q6ZSA7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LRRC55Q6ZSA7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms