Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SFTA2Q6UW10 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SFTA2Q6UW10 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFTA2Q6UW10 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFTA2Q6UW10 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFTA2Q6UW10 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFTA2Q6UW10 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFTA2Q6UW10 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFTA2Q6UW10 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFTA2Q6UW10 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFTA2Q6UW10 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFTA2Q6UW10 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFTA2Q6UW10 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFTA2Q6UW10 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFTA2Q6UW10 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFTA2Q6UW10 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFTA2Q6UW10 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFTA2Q6UW10 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFTA2Q6UW10 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFTA2Q6UW10 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFTA2Q6UW10 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SFTA2Q6UW10 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SFTA2Q6UW10 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SFTA2Q6UW10 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SFTA2Q6UW10 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SFTA2Q6UW10 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SFTA2Q6UW10 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SFTA2Q6UW10 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFTA2Q6UW10 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SFTA2Q6UW10 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SFTA2Q6UW10 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SFTA2Q6UW10 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SFTA2Q6UW10 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SFTA2Q6UW10 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SFTA2Q6UW10 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SFTA2Q6UW10 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFTA2Q6UW10 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFTA2Q6UW10 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFTA2Q6UW10 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFTA2Q6UW10 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFTA2Q6UW10 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFTA2Q6UW10 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFTA2Q6UW10 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFTA2Q6UW10 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFTA2Q6UW10 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFTA2Q6UW10 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFTA2Q6UW10 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFTA2Q6UW10 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFTA2Q6UW10 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFTA2Q6UW10 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFTA2Q6UW10 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFTA2Q6UW10 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFTA2Q6UW10 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFTA2Q6UW10 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFTA2Q6UW10 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFTA2Q6UW10 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFTA2Q6UW10 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SFTA2Q6UW10 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SFTA2Q6UW10 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SFTA2Q6UW10 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SFTA2Q6UW10 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SFTA2Q6UW10 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SFTA2Q6UW10 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SFTA2Q6UW10 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SFTA2Q6UW10 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SFTA2Q6UW10 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SFTA2Q6UW10 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SFTA2Q6UW10 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SFTA2Q6UW10 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SFTA2Q6UW10 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SFTA2Q6UW10 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SFTA2Q6UW10 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SFTA2Q6UW10 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SFTA2Q6UW10 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFTA2Q6UW10 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFTA2Q6UW10 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFTA2Q6UW10 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFTA2Q6UW10 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFTA2Q6UW10 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFTA2Q6UW10 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFTA2Q6UW10 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFTA2Q6UW10 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFTA2Q6UW10 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SFTA2Q6UW10 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFTA2Q6UW10 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFTA2Q6UW10 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFTA2Q6UW10 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFTA2Q6UW10 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFTA2Q6UW10 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFTA2Q6UW10 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFTA2Q6UW10 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFTA2Q6UW10 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFTA2Q6UW10 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFTA2Q6UW10 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFTA2Q6UW10 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFTA2Q6UW10 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFTA2Q6UW10 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFTA2Q6UW10 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFTA2Q6UW10 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFTA2Q6UW10 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms