Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUM9

RETSAT, All-trans-retinol 13,14-reductase, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETSATQ6NUM9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RETSATQ6NUM9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RETSATQ6NUM9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RETSATQ6NUM9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
RETSATQ6NUM9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RETSATQ6NUM9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RETSATQ6NUM9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RETSATQ6NUM9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RETSATQ6NUM9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RETSATQ6NUM9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RETSATQ6NUM9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
RETSATQ6NUM9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RETSATQ6NUM9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RETSATQ6NUM9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RETSATQ6NUM9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RETSATQ6NUM9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RETSATQ6NUM9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RETSATQ6NUM9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RETSATQ6NUM9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RETSATQ6NUM9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RETSATQ6NUM9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RETSATQ6NUM9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RETSATQ6NUM9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RETSATQ6NUM9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RETSATQ6NUM9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RETSATQ6NUM9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RETSATQ6NUM9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RETSATQ6NUM9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RETSATQ6NUM9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RETSATQ6NUM9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RETSATQ6NUM9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RETSATQ6NUM9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RETSATQ6NUM9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RETSATQ6NUM9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RETSATQ6NUM9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RETSATQ6NUM9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RETSATQ6NUM9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RETSATQ6NUM9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RETSATQ6NUM9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RETSATQ6NUM9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RETSATQ6NUM9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RETSATQ6NUM9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RETSATQ6NUM9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
RETSATQ6NUM9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RETSATQ6NUM9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RETSATQ6NUM9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RETSATQ6NUM9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RETSATQ6NUM9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RETSATQ6NUM9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RETSATQ6NUM9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RETSATQ6NUM9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RETSATQ6NUM9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RETSATQ6NUM9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RETSATQ6NUM9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RETSATQ6NUM9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RETSATQ6NUM9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RETSATQ6NUM9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RETSATQ6NUM9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RETSATQ6NUM9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RETSATQ6NUM9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RETSATQ6NUM9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RETSATQ6NUM9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RETSATQ6NUM9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RETSATQ6NUM9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RETSATQ6NUM9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RETSATQ6NUM9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RETSATQ6NUM9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RETSATQ6NUM9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RETSATQ6NUM9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RETSATQ6NUM9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RETSATQ6NUM9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RETSATQ6NUM9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RETSATQ6NUM9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RETSATQ6NUM9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RETSATQ6NUM9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RETSATQ6NUM9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RETSATQ6NUM9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RETSATQ6NUM9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RETSATQ6NUM9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RETSATQ6NUM9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RETSATQ6NUM9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RETSATQ6NUM9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RETSATQ6NUM9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RETSATQ6NUM9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RETSATQ6NUM9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RETSATQ6NUM9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RETSATQ6NUM9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RETSATQ6NUM9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RETSATQ6NUM9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RETSATQ6NUM9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RETSATQ6NUM9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RETSATQ6NUM9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RETSATQ6NUM9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RETSATQ6NUM9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RETSATQ6NUM9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RETSATQ6NUM9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RETSATQ6NUM9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RETSATQ6NUM9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RETSATQ6NUM9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RETSATQ6NUM9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms