Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ55

TTBK2, Tau-tubulin kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTBK2Q6IQ55 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
TTBK2Q6IQ55 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TTBK2Q6IQ55 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TTBK2Q6IQ55 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TTBK2Q6IQ55 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TTBK2Q6IQ55 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TTBK2Q6IQ55 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TTBK2Q6IQ55 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TTBK2Q6IQ55 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TTBK2Q6IQ55 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
TTBK2Q6IQ55 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TTBK2Q6IQ55 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TTBK2Q6IQ55 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TTBK2Q6IQ55 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TTBK2Q6IQ55 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TTBK2Q6IQ55 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TTBK2Q6IQ55 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TTBK2Q6IQ55 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TTBK2Q6IQ55 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TTBK2Q6IQ55 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TTBK2Q6IQ55 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TTBK2Q6IQ55 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TTBK2Q6IQ55 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TTBK2Q6IQ55 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
TTBK2Q6IQ55 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TTBK2Q6IQ55 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TTBK2Q6IQ55 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TTBK2Q6IQ55 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TTBK2Q6IQ55 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TTBK2Q6IQ55 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TTBK2Q6IQ55 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TTBK2Q6IQ55 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TTBK2Q6IQ55 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TTBK2Q6IQ55 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TTBK2Q6IQ55 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TTBK2Q6IQ55 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TTBK2Q6IQ55 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TTBK2Q6IQ55 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TTBK2Q6IQ55 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TTBK2Q6IQ55 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TTBK2Q6IQ55 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TTBK2Q6IQ55 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TTBK2Q6IQ55 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TTBK2Q6IQ55 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TTBK2Q6IQ55 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TTBK2Q6IQ55 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TTBK2Q6IQ55 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TTBK2Q6IQ55 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TTBK2Q6IQ55 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TTBK2Q6IQ55 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TTBK2Q6IQ55 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TTBK2Q6IQ55 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TTBK2Q6IQ55 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TTBK2Q6IQ55 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
TTBK2Q6IQ55 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TTBK2Q6IQ55 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TTBK2Q6IQ55 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TTBK2Q6IQ55 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TTBK2Q6IQ55 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TTBK2Q6IQ55 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TTBK2Q6IQ55 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TTBK2Q6IQ55 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TTBK2Q6IQ55 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TTBK2Q6IQ55 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TTBK2Q6IQ55 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TTBK2Q6IQ55 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TTBK2Q6IQ55 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TTBK2Q6IQ55 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TTBK2Q6IQ55 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TTBK2Q6IQ55 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TTBK2Q6IQ55 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
TTBK2Q6IQ55 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TTBK2Q6IQ55 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
TTBK2Q6IQ55 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TTBK2Q6IQ55 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TTBK2Q6IQ55 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TTBK2Q6IQ55 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TTBK2Q6IQ55 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TTBK2Q6IQ55 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TTBK2Q6IQ55 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TTBK2Q6IQ55 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TTBK2Q6IQ55 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TTBK2Q6IQ55 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TTBK2Q6IQ55 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TTBK2Q6IQ55 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TTBK2Q6IQ55 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TTBK2Q6IQ55 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TTBK2Q6IQ55 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
TTBK2Q6IQ55 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TTBK2Q6IQ55 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TTBK2Q6IQ55 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TTBK2Q6IQ55 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TTBK2Q6IQ55 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TTBK2Q6IQ55 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TTBK2Q6IQ55 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
TTBK2Q6IQ55 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
TTBK2Q6IQ55 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TTBK2Q6IQ55 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
TTBK2Q6IQ55 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TTBK2Q6IQ55 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms