Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RALGAPA1Q6GYQ0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RALGAPA1Q6GYQ0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RALGAPA1Q6GYQ0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RALGAPA1Q6GYQ0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RALGAPA1Q6GYQ0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RALGAPA1Q6GYQ0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RALGAPA1Q6GYQ0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RALGAPA1Q6GYQ0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RALGAPA1Q6GYQ0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RALGAPA1Q6GYQ0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
RALGAPA1Q6GYQ0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RALGAPA1Q6GYQ0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RALGAPA1Q6GYQ0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RALGAPA1Q6GYQ0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RALGAPA1Q6GYQ0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RALGAPA1Q6GYQ0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RALGAPA1Q6GYQ0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RALGAPA1Q6GYQ0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RALGAPA1Q6GYQ0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RALGAPA1Q6GYQ0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RALGAPA1Q6GYQ0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RALGAPA1Q6GYQ0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RALGAPA1Q6GYQ0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RALGAPA1Q6GYQ0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RALGAPA1Q6GYQ0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RALGAPA1Q6GYQ0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RALGAPA1Q6GYQ0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RALGAPA1Q6GYQ0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RALGAPA1Q6GYQ0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RALGAPA1Q6GYQ0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RALGAPA1Q6GYQ0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RALGAPA1Q6GYQ0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RALGAPA1Q6GYQ0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RALGAPA1Q6GYQ0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RALGAPA1Q6GYQ0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RALGAPA1Q6GYQ0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RALGAPA1Q6GYQ0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RALGAPA1Q6GYQ0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RALGAPA1Q6GYQ0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RALGAPA1Q6GYQ0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RALGAPA1Q6GYQ0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RALGAPA1Q6GYQ0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RALGAPA1Q6GYQ0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RALGAPA1Q6GYQ0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RALGAPA1Q6GYQ0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RALGAPA1Q6GYQ0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RALGAPA1Q6GYQ0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RALGAPA1Q6GYQ0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RALGAPA1Q6GYQ0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RALGAPA1Q6GYQ0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RALGAPA1Q6GYQ0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RALGAPA1Q6GYQ0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
RALGAPA1Q6GYQ0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RALGAPA1Q6GYQ0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RALGAPA1Q6GYQ0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RALGAPA1Q6GYQ0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RALGAPA1Q6GYQ0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RALGAPA1Q6GYQ0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RALGAPA1Q6GYQ0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RALGAPA1Q6GYQ0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RALGAPA1Q6GYQ0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RALGAPA1Q6GYQ0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RALGAPA1Q6GYQ0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RALGAPA1Q6GYQ0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RALGAPA1Q6GYQ0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RALGAPA1Q6GYQ0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RALGAPA1Q6GYQ0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RALGAPA1Q6GYQ0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RALGAPA1Q6GYQ0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RALGAPA1Q6GYQ0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RALGAPA1Q6GYQ0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RALGAPA1Q6GYQ0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RALGAPA1Q6GYQ0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RALGAPA1Q6GYQ0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RALGAPA1Q6GYQ0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RALGAPA1Q6GYQ0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RALGAPA1Q6GYQ0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RALGAPA1Q6GYQ0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RALGAPA1Q6GYQ0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RALGAPA1Q6GYQ0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RALGAPA1Q6GYQ0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RALGAPA1Q6GYQ0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RALGAPA1Q6GYQ0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RALGAPA1Q6GYQ0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RALGAPA1Q6GYQ0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RALGAPA1Q6GYQ0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RALGAPA1Q6GYQ0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RALGAPA1Q6GYQ0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RALGAPA1Q6GYQ0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RALGAPA1Q6GYQ0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RALGAPA1Q6GYQ0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RALGAPA1Q6GYQ0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms