Protein–RNA interactions for Protein: Q66K80

RUSC1-AS1, Putative uncharacterized protein RUSC1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1-AS1Q66K80 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUSC1-AS1Q66K80 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUSC1-AS1Q66K80 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUSC1-AS1Q66K80 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUSC1-AS1Q66K80 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUSC1-AS1Q66K80 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUSC1-AS1Q66K80 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUSC1-AS1Q66K80 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUSC1-AS1Q66K80 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUSC1-AS1Q66K80 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUSC1-AS1Q66K80 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUSC1-AS1Q66K80 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUSC1-AS1Q66K80 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUSC1-AS1Q66K80 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUSC1-AS1Q66K80 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUSC1-AS1Q66K80 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUSC1-AS1Q66K80 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUSC1-AS1Q66K80 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUSC1-AS1Q66K80 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RUSC1-AS1Q66K80 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUSC1-AS1Q66K80 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUSC1-AS1Q66K80 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUSC1-AS1Q66K80 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUSC1-AS1Q66K80 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUSC1-AS1Q66K80 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUSC1-AS1Q66K80 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUSC1-AS1Q66K80 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUSC1-AS1Q66K80 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUSC1-AS1Q66K80 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUSC1-AS1Q66K80 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUSC1-AS1Q66K80 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUSC1-AS1Q66K80 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUSC1-AS1Q66K80 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUSC1-AS1Q66K80 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUSC1-AS1Q66K80 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUSC1-AS1Q66K80 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUSC1-AS1Q66K80 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RUSC1-AS1Q66K80 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUSC1-AS1Q66K80 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUSC1-AS1Q66K80 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUSC1-AS1Q66K80 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUSC1-AS1Q66K80 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUSC1-AS1Q66K80 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUSC1-AS1Q66K80 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUSC1-AS1Q66K80 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUSC1-AS1Q66K80 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUSC1-AS1Q66K80 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUSC1-AS1Q66K80 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUSC1-AS1Q66K80 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUSC1-AS1Q66K80 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUSC1-AS1Q66K80 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUSC1-AS1Q66K80 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUSC1-AS1Q66K80 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUSC1-AS1Q66K80 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUSC1-AS1Q66K80 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUSC1-AS1Q66K80 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUSC1-AS1Q66K80 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUSC1-AS1Q66K80 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUSC1-AS1Q66K80 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RUSC1-AS1Q66K80 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUSC1-AS1Q66K80 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUSC1-AS1Q66K80 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUSC1-AS1Q66K80 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUSC1-AS1Q66K80 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUSC1-AS1Q66K80 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUSC1-AS1Q66K80 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUSC1-AS1Q66K80 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUSC1-AS1Q66K80 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUSC1-AS1Q66K80 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUSC1-AS1Q66K80 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RUSC1-AS1Q66K80 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUSC1-AS1Q66K80 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUSC1-AS1Q66K80 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUSC1-AS1Q66K80 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUSC1-AS1Q66K80 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUSC1-AS1Q66K80 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUSC1-AS1Q66K80 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUSC1-AS1Q66K80 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUSC1-AS1Q66K80 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUSC1-AS1Q66K80 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUSC1-AS1Q66K80 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUSC1-AS1Q66K80 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUSC1-AS1Q66K80 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RUSC1-AS1Q66K80 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUSC1-AS1Q66K80 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUSC1-AS1Q66K80 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUSC1-AS1Q66K80 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUSC1-AS1Q66K80 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUSC1-AS1Q66K80 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUSC1-AS1Q66K80 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RUSC1-AS1Q66K80 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUSC1-AS1Q66K80 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUSC1-AS1Q66K80 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUSC1-AS1Q66K80 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUSC1-AS1Q66K80 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUSC1-AS1Q66K80 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUSC1-AS1Q66K80 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUSC1-AS1Q66K80 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUSC1-AS1Q66K80 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUSC1-AS1Q66K80 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms