Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT28

FAM27B, Protein FAM27A/B/C, humanhuman

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27BQ5VT28 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM27BQ5VT28 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM27BQ5VT28 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM27BQ5VT28 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM27BQ5VT28 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FAM27BQ5VT28 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM27BQ5VT28 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM27BQ5VT28 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM27BQ5VT28 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM27BQ5VT28 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM27BQ5VT28 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM27BQ5VT28 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM27BQ5VT28 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM27BQ5VT28 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM27BQ5VT28 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM27BQ5VT28 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM27BQ5VT28 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM27BQ5VT28 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM27BQ5VT28 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM27BQ5VT28 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM27BQ5VT28 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM27BQ5VT28 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM27BQ5VT28 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM27BQ5VT28 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM27BQ5VT28 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM27BQ5VT28 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM27BQ5VT28 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM27BQ5VT28 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM27BQ5VT28 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM27BQ5VT28 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM27BQ5VT28 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM27BQ5VT28 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM27BQ5VT28 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM27BQ5VT28 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM27BQ5VT28 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM27BQ5VT28 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM27BQ5VT28 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM27BQ5VT28 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM27BQ5VT28 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM27BQ5VT28 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM27BQ5VT28 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM27BQ5VT28 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM27BQ5VT28 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM27BQ5VT28 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM27BQ5VT28 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM27BQ5VT28 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM27BQ5VT28 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM27BQ5VT28 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FAM27BQ5VT28 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM27BQ5VT28 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM27BQ5VT28 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM27BQ5VT28 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM27BQ5VT28 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM27BQ5VT28 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM27BQ5VT28 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM27BQ5VT28 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM27BQ5VT28 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM27BQ5VT28 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM27BQ5VT28 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM27BQ5VT28 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM27BQ5VT28 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM27BQ5VT28 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM27BQ5VT28 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM27BQ5VT28 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM27BQ5VT28 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM27BQ5VT28 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM27BQ5VT28 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM27BQ5VT28 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM27BQ5VT28 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM27BQ5VT28 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM27BQ5VT28 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM27BQ5VT28 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM27BQ5VT28 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM27BQ5VT28 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM27BQ5VT28 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM27BQ5VT28 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM27BQ5VT28 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM27BQ5VT28 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM27BQ5VT28 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM27BQ5VT28 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM27BQ5VT28 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM27BQ5VT28 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM27BQ5VT28 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM27BQ5VT28 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM27BQ5VT28 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM27BQ5VT28 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM27BQ5VT28 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM27BQ5VT28 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM27BQ5VT28 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM27BQ5VT28 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM27BQ5VT28 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM27BQ5VT28 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM27BQ5VT28 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM27BQ5VT28 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM27BQ5VT28 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM27BQ5VT28 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM27BQ5VT28 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM27BQ5VT28 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM27BQ5VT28 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM27BQ5VT28 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms