Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPANXN1Q5VSR9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPANXN1Q5VSR9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SPANXN1Q5VSR9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPANXN1Q5VSR9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPANXN1Q5VSR9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPANXN1Q5VSR9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPANXN1Q5VSR9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPANXN1Q5VSR9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPANXN1Q5VSR9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPANXN1Q5VSR9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPANXN1Q5VSR9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPANXN1Q5VSR9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPANXN1Q5VSR9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPANXN1Q5VSR9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPANXN1Q5VSR9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPANXN1Q5VSR9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPANXN1Q5VSR9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPANXN1Q5VSR9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPANXN1Q5VSR9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPANXN1Q5VSR9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPANXN1Q5VSR9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPANXN1Q5VSR9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPANXN1Q5VSR9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPANXN1Q5VSR9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPANXN1Q5VSR9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPANXN1Q5VSR9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPANXN1Q5VSR9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPANXN1Q5VSR9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPANXN1Q5VSR9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPANXN1Q5VSR9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SPANXN1Q5VSR9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPANXN1Q5VSR9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPANXN1Q5VSR9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPANXN1Q5VSR9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPANXN1Q5VSR9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPANXN1Q5VSR9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPANXN1Q5VSR9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPANXN1Q5VSR9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SPANXN1Q5VSR9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPANXN1Q5VSR9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPANXN1Q5VSR9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPANXN1Q5VSR9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPANXN1Q5VSR9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPANXN1Q5VSR9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPANXN1Q5VSR9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPANXN1Q5VSR9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPANXN1Q5VSR9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPANXN1Q5VSR9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPANXN1Q5VSR9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPANXN1Q5VSR9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPANXN1Q5VSR9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPANXN1Q5VSR9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPANXN1Q5VSR9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPANXN1Q5VSR9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPANXN1Q5VSR9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPANXN1Q5VSR9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPANXN1Q5VSR9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPANXN1Q5VSR9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPANXN1Q5VSR9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPANXN1Q5VSR9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPANXN1Q5VSR9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPANXN1Q5VSR9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPANXN1Q5VSR9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPANXN1Q5VSR9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPANXN1Q5VSR9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPANXN1Q5VSR9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPANXN1Q5VSR9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPANXN1Q5VSR9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPANXN1Q5VSR9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPANXN1Q5VSR9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPANXN1Q5VSR9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPANXN1Q5VSR9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPANXN1Q5VSR9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPANXN1Q5VSR9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPANXN1Q5VSR9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPANXN1Q5VSR9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPANXN1Q5VSR9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPANXN1Q5VSR9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPANXN1Q5VSR9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPANXN1Q5VSR9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPANXN1Q5VSR9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPANXN1Q5VSR9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPANXN1Q5VSR9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPANXN1Q5VSR9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPANXN1Q5VSR9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPANXN1Q5VSR9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPANXN1Q5VSR9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPANXN1Q5VSR9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPANXN1Q5VSR9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPANXN1Q5VSR9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPANXN1Q5VSR9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPANXN1Q5VSR9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPANXN1Q5VSR9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPANXN1Q5VSR9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPANXN1Q5VSR9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPANXN1Q5VSR9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPANXN1Q5VSR9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPANXN1Q5VSR9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPANXN1Q5VSR9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms